Molekulární diagnostika bakterií mléčného kvašení rodu Bifidobacterium
Práce byla zaměřena na rodově a druhově specifickou identifikaci 45 nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium izolovaných ze stolice kojenců. Jako kontrola bylo použito 11 typových a sbírkových kmenů. Bakteriální kultury jednotlivých kmenů byly kultivovány na M.R.S. médiu s přídavkem 0,05 % L-cyste...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2007.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/67567/prif_m/ |
| Shrnutí: | Práce byla zaměřena na rodově a druhově specifickou identifikaci 45 nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium izolovaných ze stolice kojenců. Jako kontrola bylo použito 11 typových a sbírkových kmenů. Bakteriální kultury jednotlivých kmenů byly kultivovány na M.R.S. médiu s přídavkem 0,05 % L-cystein hydrochloridu. Z čistých kultur byla DNA izolována metodou lyze buněk, purifikována fenolovou extrakcí a přesrážena 96 % ethanolem. Čistota a koncentrace DNA byly stanoveny spektrofotometricky. Zařazení do rodu Bifidobacterium bylo u 36 kmenů potvrzeno rodově specifickou PCR. Druhová identifikace byla ověřena pomocí PCR s druhově specifickými primery, metodou restrikční analýzy PCR amplionů s využitím 5 restrikčních endonukleáz: AluI, BamHI, Sau3AI, Sau96I, TaqI (ARDRA). Zařazení do druhů bylo ověřováno typizační metodou rep-PCR s primery (GTG)5 a BOXA1R. Z analyzovaného souboru 36 kmenů bylo 7 kmenů zařazeno do druhu B. longum, 21 kmenů do druhu B. infantis, 5 kmenů do druh. This study was focused on the genus- and species-specific identification of 36 new bifidobacterial strains isolated from stool samples of sucking babies by molecular biological methods. Thirty-six bifidobacterial strains were identified by genus-specific PCR as the Bifidobacterium genus. For the identification to species level, species-specific PCR, DNA restriction analysis (ARDRA) of PCR amplicons, and rep-PCR using 2 primers (GTG)5 and BOXA1R were used, respectively. The 36 strains tested were classified into 4 species of the Bifidobacterium genus; 2 strains were identified as mixed cultures. The intra-specific variability among the analysed strains was found by rep-PCR. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Bohuslav Rittich. |
| Fyzický popis: | 86 l., [1] l. příl. |