Molekulární diagnostika bakterií mléčného kvašení rodu Lactobacillus
Cílem diplomové práce byla rodově a druhově specifická identifikace 26 kmenů bakterií rodu Lactobacillus, izolovaných ze vzorků lidské stolice, deponovaných ve Sbírce mlékařských kultur Laktoflora (Tábor). Bakteriální DNA byla izolována metodou fenolové extrakce. Zařazení do rodu bylo ověřeno pomocí...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2007.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/85166/prif_m/ |
| Shrnutí: | Cílem diplomové práce byla rodově a druhově specifická identifikace 26 kmenů bakterií rodu Lactobacillus, izolovaných ze vzorků lidské stolice, deponovaných ve Sbírce mlékařských kultur Laktoflora (Tábor). Bakteriální DNA byla izolována metodou fenolové extrakce. Zařazení do rodu bylo ověřeno pomocí metody PCR. Dále byla u studovaných kmenů stanovena příbuznost pomocí molekulárně typizačních metod RAPD s využitím primeru M 13 a rep-PCR s využitím primeru (GTG)5. S využitím UPGMA a Pearsonových korelačních koeficientů byly zkonstruovány dendrogramy a jejich vyhodnocením bylo potvrzeno zařazení některých testovaných kmenů. The aim of the work was genus- and species-specific identification of 26 strains of the Lactobacillus genus isolated from human stool samples and collected in the Culture Collection of Dairy Microorganisms (CCDM) Laktoflora (Tábor). Bacterial DNAs were isolated using the phenol extraction method. Confirmation identification of the strains was carried out by the genus- specific PCR. RAPD with M 13 primer and rep-PCR with primer (GTG)5 were applied for discrimination among the analysed species. The similarity of the RAPD banding pattern as well as the similarity of the (GTG)5 banding pattern were calculated using the Pearson’s correlation coefficient and some strains were identified into species. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Alena Španová. |
| Fyzický popis: | 79 l. : il. |