Analýza repetitivní DNA v eukaryotických genomech /

Tato diplomová práce je zaměřena na repetitivní DNA v genomech rostlin - rodu Allium. Konkrétně se zabývá identifikací, charakterizací a kvantifikací repetic u A. cepa, A. sativum a A. ursinum. V úvodu této práce jsou shrnuty poznatky ze současné literatury o klasifikaci, významu, funkci a charakter...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Ihradská, Veronika (Autor práce)
Další autoři: Peška, Vratislav, 1978- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Slovenština
Vydáno: 2018
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/p1kmg/
Obálka
LEADER 05507ctm a22008537i 4500
001 MUB01006420919
003 CZ BrMU
005 20181217144933.0
008 180623s2018 xr ||||| |||||||||||slo d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-01-14 
035 |a (ISMU-VSKP)296053 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 575.111  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
100 1 |a Ihradská, Veronika  |% UČO 423583  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Analysis of repetitive DNA in eukaryotic genomes  |y eng 
245 1 0 |a Analýza repetitivní DNA v eukaryotických genomech /  |c Veronika Ihradská 
264 0 |c 2018 
300 |a 99 listů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Vratislav Peška 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2018 
520 2 |a Tato diplomová práce je zaměřena na repetitivní DNA v genomech rostlin - rodu Allium. Konkrétně se zabývá identifikací, charakterizací a kvantifikací repetic u A. cepa, A. sativum a A. ursinum. V úvodu této práce jsou shrnuty poznatky ze současné literatury o klasifikaci, významu, funkci a charakterizaci repetic včetne neobvyklých telomerových sekvencí. V praktické části této práce je vůbec poprvé provedena lokalizace telomerické sekvence na metafázních chromozomech A. sativum (2n = 16). Komparativní studie repetitivní DNA v genomu A. cepa a A. sativum, které jsou si evolučně blízké a v genomu A. ursinum, který je od zmíněných dvou evolučně vzdálený, byla provedena pomocí nástroje RepeatExplorer a Tandem Repeats Finder. Vybrané identifikované tandemové repetice byly lokalizovany pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH) na metafázních chromozomech a jejich relativní podíl v genomu byl odhadnut pomocí dot-blotu. Z výsledků této práce vyplýva, že telomerová sekvence 5´-(CTCGGTTATGG  |% cze 
520 2 9 |a This diploma thesis is focused on repetitive DNA in plant genomes - genus Allium. In particular, the identification, characterization and quantification of the repeats in A. cepa, A. sativum and A. ursinum is lacking. At the beginning of this work the findings from the current literature on the classification, significance, function and characterization of repetition are summarized, including unusual telomeric sequences. In the practical part of this work, localization of the telomeric sequence on metaphase chromosomes A. sativum (2n = 16) was declared for the first time. A comparative study of repetitive DNA in A. cepa and A. sativum, which are evolutionarily close, and in the species A. ursinum, which is from the two evolutionarily remote, was done using the RepeatExplorer and Tandem Repeats Finder. Selected identified tandem repeats were localized by fluorescence in situ hybridization (FISH) on metaphase chromosomes and their abundancy in the genome was estimated by dot-blot. The re  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a genom  |7 ph136488  |2 czenas 
650 0 7 |a hybridizace in situ fluorescenční  |2 czmesh 
650 0 7 |a imunoblotting  |2 czmesh 
650 0 7 |a RepeatExplorer  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a genome  |2 eczenas 
650 0 2 |a Immunoblotting 
650 0 2 |a In Situ Hybridization, Fluorescence 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Genomika a proteomika  |c PřF N-BCH GEPR (GEPR)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Peška, Vratislav,  |d 1978-  |7 mub20211130857  |% UČO 21286  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/p1kmg/ 
CAT |c 20180623  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1416 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20181217  |l MUB01  |h 1449 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1817 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2022 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |c 20190114  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0153 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0736 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0743 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0747 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0750 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1029 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2015 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20211108  |l MUB01  |h 1520 
CAT |c 20240209  |l MUB01  |h 1158 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-01-14 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-16270  |5 3285016645  |8 20181217  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20181217  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-16270  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD