Studies of quadruplex nucleic acids /

Guaninové kvadruplexy jsou pravděpodobně nejdůležitější nekanonickou formou DNA. Hrají roli v důležitých buněčných procesech, mezi které patří ochrana konců lineárních chromosomů (telomer), regulace transkripce a translace nebo interakce hostitel-virus. Mutace v nukleotidových sekvencích tvořících k...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Stadlbauer, Petr (Autor práce)
Další autoři: Šponer, Jiří, 1964- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/323416/prif_d/
Obálka
LEADER 06605ctm a22011057i 4500
001 MUB01006407652
003 CZ BrMU
005 20181113144758.0
008 171215s2017 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-12-17 
035 |a (ISMU-VSKP)246993 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 544.112:531.3  |2 MRF 
100 1 |a Stadlbauer, Petr  |% UČO 323416  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Studium kvadruplexů nukleových kyselin  |y eng 
245 1 0 |a Studies of quadruplex nucleic acids /  |c Petr Stadlbauer 
264 0 |c 2017 
300 |a 182 různě číslovaných listů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Jiří Šponer 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2017 
520 2 |a Guaninové kvadruplexy jsou pravděpodobně nejdůležitější nekanonickou formou DNA. Hrají roli v důležitých buněčných procesech, mezi které patří ochrana konců lineárních chromosomů (telomer), regulace transkripce a translace nebo interakce hostitel-virus. Mutace v nukleotidových sekvencích tvořících kvadruplexy může vést ke vzniku různých onemocnění, jako například demence nebo rakovina. Interakce kvadruplexů s malými molekulami léčiv se zdá být jednou z možností, jak proti těmto chorobám bojovat. Tato práce se zabývá mechanismem sbalování guaninových kvadruplexů, zejména pak těch tvořených lidskou telomerní sekvencí. V této práci používáme moderní výpočetní metody založené na molekulové dynamice. Testovali jsme, jestli se dříve navržené meziprodukty sbalování skutečně mohou tohoto děje účastnit, a zároveň jsme se pokusili zjistit, jestli se sbalování neúčastní i dosud neidentifikované intermediáty. Specificky jsme se zaměřili na guaninový triplex a guaninovou vlásenku.  |% cze 
520 2 9 |a Guanine quadruplexes are the most important non-canonical DNA architectures. They are involved in many important cellular processes. For example, protection of the ends of linear chromosomes (telomeres), transcriptional and translational regulation or host-virus interaction. Mutations in G-quadruplex forming sequences can lead to various diseases, including dementia and cancer. Targeting G-quadruplex structures by small ligands has been suggested as potential approach in their treatment. This thesis deals with the mechanism of DNA G-quadruplex folding, with special attention paid to the human telomeric sequence. We use the state-of-the-art molecular dynamics methods to verify the existence of various suggested folding intermediates and predict the presence of those not yet identified. Specifically, we probe the G-triplex and G-hairpin structures. The results show that although they might exist, the most important feature of the folding landscape is the presence of many deep basins ...  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a kvadruplexy  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a molekulární dynamika  |7 ph202577  |2 czenas 
650 0 7 |a nukleové kyseliny  |7 ph115470  |2 czenas 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular dynamics  |2 eczenas 
650 0 9 |a nucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a quadruplexes  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biochemie (čtyřleté)  |b Biomolekulární chemie  |c PřF D-BCH4 BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Šponer, Jiří,  |d 1964-  |7 ola2003204899  |% UČO 28764  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/323416/prif_d/ 
CAT |c 20171215  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20171219  |l MUB01  |h 1213 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0906 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20181113  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20181217  |l MUB01  |h 1102 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1212 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1219 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1135 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1026 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2013 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1258 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2119 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221101  |l MUB01  |h 0912 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2353 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231012  |l MUB01  |h 2100 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240513  |l MUB01  |h 1950 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-12-17 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-16246  |5 3285016487  |8 20181113  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20181113  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-16246  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD