Analysis of non-coding RNAs and their role in the biology of malignant B cells /

Cílem této bakalářské práce bylo analyzovat 16 vzorků od pacientů s chronickou lymfocytární leukémií získaných pomocí technologie sekvenování nové generace se zaměřením na dlouhé nekódující RNA. Tato třída nekódujících RNA má velký potenciál pro regulaci genové exprese a její spojení se vznikem mnoh...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Trachtová, Karolína (Autor práce)
Další autoři: Mráz, Marek (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2016
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/422653/prif_b/
Obálka
LEADER 05935ctm a22009617i 4500
001 MUB01006369804
003 CZ BrMU
005 20160830103826.0
008 160623s2016 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-10-09 
035 |a (ISMU-VSKP)288241 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.212.3  |2 MRF 
080 |a 616.155.392  |2 MRF 
100 1 |a Trachtová, Karolína  |% UČO 422653  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a Analysis of non-coding RNAs and their role in the biology of malignant B cells /  |c Karolína Trachtová 
246 1 1 |a Analýza nekódujících RNA a jejich úlohy v biologii maligních B buněk 
264 0 |c 2016 
300 |a vii, 62 listů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Marek Mráz 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2016 
520 2 |a Cílem této bakalářské práce bylo analyzovat 16 vzorků od pacientů s chronickou lymfocytární leukémií získaných pomocí technologie sekvenování nové generace se zaměřením na dlouhé nekódující RNA. Tato třída nekódujících RNA má velký potenciál pro regulaci genové exprese a její spojení se vznikem mnoha typů rakoviny je dnes všeobecně uznáváno. Během práce byla vytvořena databáze dlouhých nekódujících RNA z 12 dostupných databází. Vzorky byly úspěšně mapovány na tuto databázi a rozdílně exprimované transkripty byly odhaleny. Pro takto získané dlouhé nekódující RNA byly predikovány možné interakce s microRNA s ohledem na konzervovanost vazebných míst v cílových sekvencích. Výsledkem této práce jsou identifikované vysoce exprimované dlouhé nekódující RNA a jejich potencionální interakce s microRNA, které mohou hrát důležitou roli v chronické lymfocytární leukémii.  |% cze 
520 2 9 |a The aim of this bachelor thesis was to analyse 16 samples from patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) obtained by Next-generation sequencing (NGS) technique with a focus on long non-coding RNAs. This class of non-coding RNAs has a great potential in regulation of gene expression and its association with origin of various types of cancer is now widely recognized. During the work, the database of long non-coding RNAs was created from 12 available databases. Samples were successfully mapped to this database and differentially expressed transcripts were discovered. For obtained differentially expressed long non-coding RNAs, possible miRNA interactions were predicted with respect to conservation of miRNAs seed regions. The results of this thesis are identified highly expressed long non-coding RNAs and their potential miRNA interactions that can play an important role in a chronic lymphocytic leukemia.  |9 eng 
650 0 7 |a chronická lymfocytární leukémie  |7 ph232604  |2 czenas 
650 0 7 |a sekvenční analýza RNA  |2 czmesh 
650 0 9 |a chronic lymphocytic leukemia  |2 eczenas 
650 0 2 |a Sequence Analysis, RNA 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Chemoinformatika a bioinformatika  |c PřF B-BCH CHI (CHI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Mráz, Marek  |7 xx0122131  |% UČO 101627  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/422653/prif_b/ 
CAT |c 20160623  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20160805  |l MUB01  |h 1323 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20160830  |l MUB01  |h 1038 
CAT |c 20161009  |l MUB01  |h 2232 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1219 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1019 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2006 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1247 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2353 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-10-09 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-13487  |5 3285010953  |8 20160830  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20160830  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-13487  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD