Detection of Sub-Resolution Spots in Microscopy Images /
Fluorescenční mikroskopie se stala jednou z klíčových metod pozorování užívaných v biomedicínském výzkumu. Umožňuje vědcům studovat a vizualizovat detaily vnitrobuněčných struktur, a s využitím různých fluorescenčních technik mohou výzkumníci pořizovat 3D snímky zobrazující chromosomy, jejich části...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2016
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/172454/fi_d/ |
| Shrnutí: | Fluorescenční mikroskopie se stala jednou z klíčových metod pozorování užívaných v biomedicínském výzkumu. Umožňuje vědcům studovat a vizualizovat detaily vnitrobuněčných struktur, a s využitím různých fluorescenčních technik mohou výzkumníci pořizovat 3D snímky zobrazující chromosomy, jejich části nebo dokonce jednotlivé geny, a tím lépe porozumět funkci a životnímu cyklu buněk. Velikost mnoha z těchto struktur se však nachází pod difrakčním limitem pro viditelné světlo, a objekty se na obrazech jeví jako malé nejasné tečky. V minulosti bylo představeno několik metod, které se na detekci takových sub-resolučních teček ve 2D a 3D obrazech zaměřují. V této práci je představeno rozsáhlé vyhodnocení řady v současnosti používaných metod. Text začíná popisem přípravy vzorků a procesu utváření obrazu v konfokální fluorescenční mikroskopii. Důraz je kladen na důležitost plného 3D vyhodnocování a použití věrně simulovaných syntetických dat. Díky měření úspěšnosti metod ve 3D, s použitím jak re In biomedical research, fluorescence microscopy has become one of the key methods of observation, allowing the researchers to study and visualize the details of intracellular structures. Using various fluorescence microscopy techniques, the researchers can acquire 3D images showing the chromosomes, their parts, and even individual genes, leading to a better understanding of the function and the life cycle of the cells. The size of many of these structures is below the diffraction limit of visible light, however, and the objects appear as small, indistinct spots in the images. Multiple image processing methods have been introduced, focusing on the detection of such sub-resolution spots in 2D and 3D images. In this thesis, an extensive evaluation of several currently used spot detection methods is presented. We start by discussing the specimen preparation and the process of image formation in a confocal fluorescence microscope, highlighting the importance of a full 3D evaluation, and of |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Pavel Matula |
| Fyzický popis: | xvi, 129 stran |