Theoretical study of carbonic anhydrase IX/
Karbonická anhydráza IX (CA IX) katalyzuje hydrataci oxidu uhličitého za vzniku hydrogenuhličitanového iontu a protonu. Jedná se důležitou reakci v mnoha fyziologických procesech, ale zároveň se podílí na udržování fyziologického pH uvnitř nádorových buněk, které jsou v hypoxickém stavu. CA IX je tu...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2015
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/376167/prif_m/ |
| Shrnutí: | Karbonická anhydráza IX (CA IX) katalyzuje hydrataci oxidu uhličitého za vzniku hydrogenuhličitanového iontu a protonu. Jedná se důležitou reakci v mnoha fyziologických procesech, ale zároveň se podílí na udržování fyziologického pH uvnitř nádorových buněk, které jsou v hypoxickém stavu. CA IX je tudíž nezbytnou součástí mechanismu, který umožňuje masivní proliferaci hypoxických nádorů. Acidifikace extracelulárního prostoru, ke které dochází, vede k zvýšenému riziku metastáz. CA IX obsahuje unikátní PG doménu, která není přítomna u ostatních izoforem karbonické anhydrázy. Skutečnost, že se jedná o CA IX unikátní doménu spolu s tím, že její třídimenzionální struktura není známa, vytváří z CA IX atraktivní cíl pro selektivní léčbu nádorových onemocnění. Chybějící 3D strukturní informace PG domény dělají z CA IX rovněž vhodný cíl molekulárně dynamických simulací. Výsledky simulací na µs škále naznačují, že PG doména je nestrukturovanou částí enzymu. Simulace rovněž odhalily důležité... Carbonic anhydrase IX (CA IX) catalyzes the hydratation of carbon dioxide to bicarbonate and proton. This reaction is vital for many physiological processes but it is also important for maintaining physiological pH inside a tumor cell exposed to hypoxia conditions. CA IX is then essential for survival of tumor cells leading to massive proliferation of tumor tissues. Moreover, low extracellular pH values caused by CA IX leads to the high risk of metastasis. CA IX contains an unique PG domain not seen in the other CA isoforms. Three dimensional structure of the PG domain is not known and since the domain is absent in other isoforms of CA IX enzyme, it becomes an interesting target for development of new anti-cancer drugs therefore computational approach was used in this work for the rationalization of its structure and behaviour. Results of MD simulations on µs timescale indicate that PG domain is an unstructured moiety of CA IX. Simulations also reveal important consequences related... |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petr Kulhánek |
| Fyzický popis: | 106 listů |