Theoretical study of carbonic anhydrase IX/

Karbonická anhydráza IX (CA IX) katalyzuje hydrataci oxidu uhličitého za vzniku hydrogenuhličitanového iontu a protonu. Jedná se důležitou reakci v mnoha fyziologických procesech, ale zároveň se podílí na udržování fyziologického pH uvnitř nádorových buněk, které jsou v hypoxickém stavu. CA IX je tu...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Škultéty, Michal (Autor práce)
Další autoři: Kulhánek, Petr, 1976- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2015
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/376167/prif_m/
Obálka
LEADER 07110ctm a22012377i 4500
001 MUB01006343335
003 CZ BrMU
005 20150727140432.0
008 150627s2015 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-03-09 
035 |a (ISMU-VSKP)270558 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.1  |2 MRF 
080 |a 544.112:531.3  |2 MRF 
080 |a 544:004  |2 MRF 
080 |a 616-006-08  |2 MRF 
100 1 |a Škultéty, Michal  |% UČO 376167  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a Theoretical study of carbonic anhydrase IX/  |c Michal Škultéty 
246 1 1 |a Teoretická studie karbonické anhydrázy IX 
264 0 |c 2015 
300 |a 106 listů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Petr Kulhánek 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2015 
520 2 |a Karbonická anhydráza IX (CA IX) katalyzuje hydrataci oxidu uhličitého za vzniku hydrogenuhličitanového iontu a protonu. Jedná se důležitou reakci v mnoha fyziologických procesech, ale zároveň se podílí na udržování fyziologického pH uvnitř nádorových buněk, které jsou v hypoxickém stavu. CA IX je tudíž nezbytnou součástí mechanismu, který umožňuje masivní proliferaci hypoxických nádorů. Acidifikace extracelulárního prostoru, ke které dochází, vede k zvýšenému riziku metastáz. CA IX obsahuje unikátní PG doménu, která není přítomna u ostatních izoforem karbonické anhydrázy. Skutečnost, že se jedná o CA IX unikátní doménu spolu s tím, že její třídimenzionální struktura není známa, vytváří z CA IX atraktivní cíl pro selektivní léčbu nádorových onemocnění. Chybějící 3D strukturní informace PG domény dělají z CA IX rovněž vhodný cíl molekulárně dynamických simulací. Výsledky simulací na µs škále naznačují, že PG doména je nestrukturovanou částí enzymu. Simulace rovněž odhalily důležité...  |% cze 
520 2 9 |a Carbonic anhydrase IX (CA IX) catalyzes the hydratation of carbon dioxide to bicarbonate and proton. This reaction is vital for many physiological processes but it is also important for maintaining physiological pH inside a tumor cell exposed to hypoxia conditions. CA IX is then essential for survival of tumor cells leading to massive proliferation of tumor tissues. Moreover, low extracellular pH values caused by CA IX leads to the high risk of metastasis. CA IX contains an unique PG domain not seen in the other CA isoforms. Three dimensional structure of the PG domain is not known and since the domain is absent in other isoforms of CA IX enzyme, it becomes an interesting target for development of new anti-cancer drugs therefore computational approach was used in this work for the rationalization of its structure and behaviour. Results of MD simulations on µs timescale indicate that PG domain is an unstructured moiety of CA IX. Simulations also reveal important consequences related...  |9 eng 
650 0 7 |a homologní modelování  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a hypoxie  |7 ph508956  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární dynamika  |7 ph202577  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulární mechanika  |7 ph579351  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulové modelování  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a počítačová chemie  |7 ph534651  |2 czenas 
650 0 7 |a protinádorová terapie  |7 ph165182  |2 czenas 
650 0 9 |a anti-cancer therapy  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a computational chemistry  |2 eczenas 
650 0 9 |a homology modelling  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a hypoxia  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular dynamics  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular mechanics  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular modelling  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biomolekulární chemie  |c PřF N-BCH BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kulhánek, Petr,  |d 1976-  |7 mub2011655677  |% UČO 9703  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/376167/prif_m/ 
CAT |c 20150627  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20150727  |l MUB01  |h 1403 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20150727  |l MUB01  |h 1404 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1453 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1415 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0548 
CAT |c 20160303  |l MUB01  |h 1235 
CAT |c 20160308  |l MUB01  |h 1506 
CAT |c 20160309  |l MUB01  |h 1108 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160731  |l MUB01  |h 2226 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1015 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2002 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1238 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230925  |l MUB01  |h 2134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-03-09 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-10962  |5 3285007790  |8 20150727  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20150727  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-10962  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD