Optimalizace Gibson assembly pro tvorbu polycistronních plasmidů určených k reprogramování somatických buněk do „medium spiny“ neuronů /

Tato diplomová práce se zaměřuje na vytvoření několika-genového DNA fragmentu ve formě lentivirového vektoru, který by mohl představovat nástroj umožňující transdiferenciaci astrocytů na neurony (konkrétně „medium spiny“ neurony). Následně by tohoto mohlo být využito při léčbě pacientů některých neu...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Brzezina, Jáchym (Autor práce)
Další autoři: Pekařík, Vladimír (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/358524/prif_m/
Obálka
LEADER 05878ctm a22009017i 4500
001 MUB01001001415
003 CZ BrMU
005 20210507134820.0
008 140627s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
035 |a (ISMU-VSKP)237393 
040 |a BOD114  |b cze  |e rda  |d BOD035 
041 0 |a eng  |b cze 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 602.6:577.112  |2 MRF 
080 |a 577.2:60  |2 MRF 
080 |a 575.13  |2 MRF 
080 |a 576.52.016  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
100 1 |a Brzezina, Jáchym  |% UČO 358524  |4 dis  |* [absolvent PřírF MU] 
242 1 0 |a Optimisation of Gibson assembly for construction of polycistronic vectors for somatic cell reprogramming into medium spiny neurons  |y eng 
245 1 0 |a Optimalizace Gibson assembly pro tvorbu polycistronních plasmidů určených k reprogramování somatických buněk do „medium spiny“ neuronů /  |c Jáchym Brzezina 
264 0 |c 2014 
300 |a 93 stran :  |b tabulky 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Vladimír Pekařík 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Tato diplomová práce se zaměřuje na vytvoření několika-genového DNA fragmentu ve formě lentivirového vektoru, který by mohl představovat nástroj umožňující transdiferenciaci astrocytů na neurony (konkrétně „medium spiny“ neurony). Následně by tohoto mohlo být využito při léčbě pacientů některých neurodegenerativních poruch spojených se ztrátou neuronů, například Huntingtonovy choroby. Teoretická část práce shrnuje různé metody spojování DNA fragmentů. Vzájemně je srovnává a popisuje jejich výhody a nevýhody. Praktická část pak využívá jednu z těchto metod, označovanou jako Gibson Assembly, která se jeví jako vhodná právě ke spojování několika delších DNA segmentů dohromady v rámci jediné izotermální reakce. První fáze experimentální části spočívala v optimalizaci PCR a docílení úspěšné a účinné amplifikace požadovaných genových fragmentů (s geny Mash1, Dlx2 a GFP), které mají být následně začleněny do vektoru, kterým byl plazmid pBOB. Následně byla provedena samotná Gibson Assembly, kt  |% cze 
520 2 9 |a The diploma thesis focuses on the assembly of a multigene DNA construct in a form of a lentiviral vector, which could potentially be used as a tool for transdifferentiation of astrocytes into neurons (particularly the medium spiny neurons). This could then present a possible way of treating patients with some neurodegenerative diseases associated with loss of neurons, such as the Huntington’s disease. The theoretical part summarizes various methods of DNA assembly and compares their advantages and disadvantages. The practical part then utilizes one of them, referred to as the Gibson Assembly, which seems as a promising new way of assembling several longer DNA fragments together in a single isothermal reaction. First part of the experimentation involved PCR optimization and subsequent amplification of the desired gene fragments (genes Mash1, Dlx2 and GFP) to be connected and integrated in to the pBOB vector. Then, the actual Gibson Assembly was performed and optimized to obtain the desi  |9 eng 
650 0 7 |a fragmentace DNA  |2 czmesh 
650 0 7 |a Gibson assembly  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a plazmidy  |7 ph124095  |2 czenas 
650 0 7 |a polymerázová řetězová reakce  |2 czmesh 
650 0 7 |a přeprogramování buněk  |2 czmesh 
650 0 7 |a rekombinantní bílkoviny  |7 ph289373  |2 czenas 
650 0 9 |a plasmids  |2 eczenas 
650 0 9 |a recombinant proteins  |2 eczenas 
650 0 2 |a Cellular Reprogramming 
650 0 2 |a DNA Fragmentation 
650 0 2 |a Polymerase Chain Reaction 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF N-EXB BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Pekařík, Vladimír  |7 xx0105829  |% UČO 115466  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie.  |b Oddělení genetiky a molekulární biologie  |7 mub20211111509  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/358524/prif_m/ 
CAT |c 20140627  |l MUB01  |h 0421 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1614 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1109 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20141029  |l MUB01  |h 1526 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1331 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1332 
CAT |c 20150724  |l MUB01  |h 1145 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a BLAZEKM  |b 02  |c 20151118  |l MUB01  |h 0921 
CAT |a BLAZEKM  |b 02  |c 20151130  |l MUB01  |h 0927 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0503 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160111  |l MUB01  |h 1025 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160222  |l MUB01  |h 1533 
CAT |c 20170119  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180917  |l MUB01  |h 1225 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1416 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1458 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201102  |l MUB01  |h 0055 
CAT |c 20210208  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20210507  |l MUB01  |h 1348 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1010 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240409  |l MUB01  |h 2331 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240409  |l MUB01  |h 2332 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11117  |5 3285008363  |8 20151118  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20151118  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11117  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD