Studium inhibitorů dehalogenáz jako potenciálních antituberkulotik
Tato práce je zaměřená na popis a srovnání nejčastěji používaných biofyzikálních metod studia interakcí protein-ligand. Metody jsem rozdělil do tří skupin na separační, spektrální a kalorimetrické. Pro každou techniku je zde stručně uveden její princip s praktickým využitím, výhodami a nevýhodami. C...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/393392/prif_b/ |
| Shrnutí: | Tato práce je zaměřená na popis a srovnání nejčastěji používaných biofyzikálních metod studia interakcí protein-ligand. Metody jsem rozdělil do tří skupin na separační, spektrální a kalorimetrické. Pro každou techniku je zde stručně uveden její princip s praktickým využitím, výhodami a nevýhodami. Cílem praktické části práce bylo důkladněji prostudovat kinetiku a mechanismus interakce vybraného inhibitoru s mykobakteriální halogenalkandehalogenázou DmbA za pomoci mikrokalorimetrických technik, konkrétně isotermální titrační kalorimetrie a diferenciální skenovací kalorimetrie. Tento enzym byl identifikován jako jeden ze tří halogenalkandehalogenáz, exprimovaných při patogenezi u původce tuberkulózy Mycobacterium tuberculosis. Ačkoliv jsou tyto enzymy známé již více než 25 let, jejich biologická funkce nebyla dosud pro řadu organismů objevena. Studium inhibitorů těchto enzymů by mohlo pomoci nejen při objasnění jejich role, ale zároveň by mohlo vést k objevení substancí s možnými antitub This Thesis is focused on description and comparison of biophysical methods that are most commonly used for study of protein-ligand interactions. Methods are divided into three groups: separative, spectral and calorimetric. The principles, together with advantages and disadvantages are briefly described for each method. The main goal of the experimental part of this Thesis is a detailed description of an interaction mechanism between mycobacterial halogenalkanedehalogenase (HLD) DmbA and selected inhibitor by microcalorimetric techniques, specifically by isothermal titration calorimetry (ITC) and differential scanning calorimetry (DSC). DmbA is one of the three dehalogenases expressed during pathogenesis of Mycobacterium tuberculosis, the cause of tuberculosis. Although HLDs has been studied for more than 25 years, their original biological function in a number of microorganisms is yet to be discovered. Detailed study of inhibitors of these enzymes could not only help us to understand |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Zbyněk Prokop |
| Fyzický popis: | 56 l., 13 příl. |