Identification and classification of nucleic acids conformations

V předložené práci je za pomocí moderních metod hustotního funkcionálu studována variace izotropních chemických posunů jader guaninu podél koordináty přechodu mezi B-DNA a A-DNA. Za účelem dekompozice rozdílů chemických posunů do jednotlivých příspěvků byla vytvořena sada speciálních modelových syst...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Mládek, Arnošt (Autor práce)
Další autoři: Kubíček, Karel, 1977- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/175116/prif_m_b1/
Obálka
LEADER 04212ctm a22006857a 4500
001 MUB01001000968
003 CZ BrMU
005 20201211114216.0
008 140625s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
035 |a (ISMU-VSKP)256395 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 544.18  |2 MRF 
100 1 |a Mládek, Arnošt  |7 xx0255112  |% UČO 175116  |4 dis 
245 1 0 |a Identification and classification of nucleic acids conformations  |h [rukopis] /  |c Arnošt Mládek 
246 1 1 |a Identifikace a klasifikace konformací nukleových kyselin 
260 |c 2014 
300 |a viii, 108 l. +  |e 1 CD-ROM 
500 |a Vedoucí práce: Karel Kubíček 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a V předložené práci je za pomocí moderních metod hustotního funkcionálu studována variace izotropních chemických posunů jader guaninu podél koordináty přechodu mezi B-DNA a A-DNA. Za účelem dekompozice rozdílů chemických posunů do jednotlivých příspěvků byla vytvořena sada speciálních modelových systémů M_n. V závěru práce je navržen robustní, spolehlivý a na stacking interakci dostatečně citlivý marker B-A přechodu, tzv. super-posun d(S). Z naměřené hodnoty d(S) je možné jednoznačně rozlišit B-DNA a A-DNA konformační substavy, a to na základě vzájemného uspořádání stackovaných nukleobází.  |% cze 
520 2 9 |a In the present study a variation of the guanine nuclei isotropic chemical shifts along the B-DNA <-> A-DNA transition pathway is studied using the state-of-the-art density functional theory (DFT) methods. Throughout the thesis several specially designed M_n model systems have been exploited for the purpose of decomposing chemical shift differences between B-DNA and A-DNA into various contributions. Finally a robust, reliable, and sufficiently stacking interaction-sensitive B-A transition marker called the chemical super-shift d(S) is proposed. According to the measured d(S) values, B-DNA and A-DNA conformational substates can be unequivocally discriminated on the basis of the nucleobases stacking arrangement.  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a chemické stínění  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a kvantová chemie  |7 ph122048  |2 czenas 
650 0 7 |a nukleové kyseliny  |7 ph115470  |2 czenas 
650 0 7 |a tenzor chemického posunu  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a teorie funkcionálu hustoty  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a density functional theory  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a chemical shielding  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a chemical shift tensor  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a nucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a quantum chemistry  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |c PřF N-BCH BIOM  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kubíček, Karel,  |d 1977-  |7 mub2013762059  |% UČO 20563  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta  |7 kn20010709281  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/175116/prif_m_b1/ 
CAT |c 20140625  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a VARTECKAX  |b 02  |c 20140708  |l MUB01  |h 0726 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20140711  |l MUB01  |h 1004 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20140711  |l MUB01  |h 1012 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1242 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0503 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20201211  |l MUB01  |h 1142 
CAT |c 20210208  |l MUB01  |h 1138 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1010 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1230 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-10127  |5 3285006742  |7 Přílohu si vyžádejte u knihovníka u výpůjčního pultu  |8 20140711  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20140711  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-10127  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD