Druhová determinace streptokoků molekulárně-biologickými metodami u pacientů s infekční endokarditidou

Infekční endokarditida (IE) je vzácné, život ohrožující infekční onemocnění endokardu. Ačkoliv jsou streptokoky druhou nejčastější příčinou IE, standardní metody druhové identifikace streptokoků a jejich nutričních variant nejsou dostačující. Výskyt streptokokových IE může být navíc v důsledku antib...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Kubasová, Tereza (Autor práce)
Další autoři: Freiberger, Tomáš, 1970- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2012
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/269844/prif_m/
Obálka
LEADER 04862ctm a22007097a 4500
001 MUB01000721735
003 CZ BrMU
005 20190911090410.0
008 120629s2012 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
035 |a (ISMU-VSKP)207479 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004 
072 7 |a 579  |x Mikrobiologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 616.126-002-022.7  |2 MRF 
080 |a 579.862  |2 MRF 
100 1 |a Kubasová, Tereza  |7 jo2017970687  |% UČO 269844  |4 dis 
242 1 0 |a Molecular identification of streptococci in patients with infective endocarditis  |y eng 
245 1 0 |a Druhová determinace streptokoků molekulárně-biologickými metodami u pacientů s infekční endokarditidou  |h [rukopis] /  |c Tereza Kubasová 
260 |c 2012 
300 |a 92 l. 
500 |a Vedoucí práce: Tomáš Freiberger 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a Infekční endokarditida (IE) je vzácné, život ohrožující infekční onemocnění endokardu. Ačkoliv jsou streptokoky druhou nejčastější příčinou IE, standardní metody druhové identifikace streptokoků a jejich nutričních variant nejsou dostačující. Výskyt streptokokových IE může být navíc v důsledku antibiotické terapie standardními kultivačními metodami podhodnocen. Spektrum deklarovaných druhů streptokoků způsobujících IE v České republice proto může být zkreslené. Vhodnou alternativou stanovení etiologie IE se jeví molekulárně-biologické metody, které umožňují přímý záchyt DNA patogenního agens bez nutnosti jeho kultivace. Cílem této diplomové práce bylo nalezení vhodné variabilní oblasti genu 16S rDNA, která by umožnila druhové rozlišení klinicky významných streptokoků. V práci byly porovnány sekvence tohoto genu u 32 druhů streptokoků a jim příbuzných bakterií. Jako nejvhodnější oblasti pro druhové rozlišení byly prokázány variabilní oblasti V2-V6.  |% cze 
520 2 9 |a Infective endocarditis (IE) is an uncommon, life-threatening infective disease of the endocardium. Although streptococci are among the most common causes of IE, standard methods of species identification of streptococci and their nutritional variants are not sufficient. The incidence of streptococcal IE may also be underestimated due to false negative results of culture tests in patients under antibiotic therapy. Therefore the epidemiology of streptococcal IE in the Czech Republic may be inaccurate/incomplete. PCR-based methods seem a suitable alternative to determine the etiology of IE. The aim of the study was to find a variable region of 16S rDNA, suitable for distinguishing streptococci to species level. In this study, 32 16S rDNA sequences of reference streptococcal strains were compared. The most suitable regions for their determination were variable regions V2-V6.  |9 eng 
650 0 7 |a infekční endokarditida  |7 ph172834  |2 czenas 
650 0 7 |a streptokoky  |7 ph534642  |2 czenas 
650 0 7 |a 16S rDNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a infective endocarditis  |2 eczenas 
650 0 9 |a Streptococcaceae  |2 eczenas 
650 0 9 |a 16S rRNA  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biologie  |b Obecná biologie  |c PřF N-BI BIOB (BIOB)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Freiberger, Tomáš,  |d 1970-  |7 xx0071641  |% UČO 24036  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/269844/prif_m/ 
CAT |c 20120629  |l MUB01  |h 0425 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120710  |l MUB01  |h 1057 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120919  |l MUB01  |h 0931 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20131018  |l MUB01  |h 1556 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20131211  |l MUB01  |h 1701 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140331  |l MUB01  |h 1528 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140808  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20140911  |l MUB01  |h 1610 
CAT |c 20140912  |l MUB01  |h 1104 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150810  |l MUB01  |h 1458 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1449 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0245 
CAT |a VARTECKAX  |b 02  |c 20190911  |l MUB01  |h 0904 
CAT |c 20200507  |l MUB01  |h 1114 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0959 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1948 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1215 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20211122  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230920  |l MUB01  |h 1940 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231204  |l MUB01  |h 1953 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-05-07 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11934  |5 3145359280  |8 20131018  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20130708  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11934  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD