The role of TRAMP complex in transposition of Ty1 elements in Saccharomyces cerevisiae

Ty1 transposony jsou mobilní genetické elementy kvasinek, které jsou strukturně i funkčně blízké retrovirům. K transposzici těchto elementů však dochází velmi zřídka, a to i přesto, že Ty1 RNA je jednou z nejhojnějších mRNA v buňce, kde tvoří až 0,8% celkové RNA. Dosud nebylo objasněno, jak buňka re...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Ostapčuk, Veronika (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2012
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/211469/prif_m/
Obálka
LEADER 06524ctm a22010697a 4500
001 MUB01000706600
003 CZ BrMU
005 20121015110728.0
008 120215s2012 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
035 |a (ISMU-VSKP)188716 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 582.282.23  |2 MRF 
100 1 |a Ostapčuk, Veronika  |% UČO 211469  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Úloha komplexu TRAMP v transpozici Ty1 elementů v Saccharomyces cerevisiae  |y cze 
245 1 4 |a The role of TRAMP complex in transposition of Ty1 elements in Saccharomyces cerevisiae  |h [rukopis] /  |c Veronika Ostapčuk 
260 |c 2012 
300 |a 47 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2012 
520 2 |a Ty1 transposony jsou mobilní genetické elementy kvasinek, které jsou strukturně i funkčně blízké retrovirům. K transposzici těchto elementů však dochází velmi zřídka, a to i přesto, že Ty1 RNA je jednou z nejhojnějších mRNA v buňce, kde tvoří až 0,8% celkové RNA. Dosud nebylo objasněno, jak buňka reguluje transpozici Ty1 elementů, ale bylo identifikováno mnoho kvasinkových genů účastnících se tohoto procesu. Cílem této práce bylo objasnění role komplexu TRAMP v transpozici Ty1 elementů. Tento komplex je zásadní komponentou kontroly kvality RNA v jádře kvasinek a skládá se z nekanonické poly(A) polymerasy Trf4/Trf5, zinkového proteinu Air1/Air2 a RNA helikasy Mtr4. TRAMP komplex je schopný rozpoznat vadnou molekulu RNA, označit jí oligo(A) koncem a tím umožnit její degradaci exosomem, makromolekulárním komplexem s 3´− 5´ exonukelasovou aktivitou. Bylo ukázáno, že delece TRF4 a TRF5 genů, jakožto i delece genu kódující exonukleasovou podjednotku exosomu, RRP6, způsobí narušení standardn  |% cze 
520 2 9 |a Ty1 transposons are mobile genetic elements which are structurally and functionally related to retroviruses. Despite the fact that Ty1 RNA is one of the most abundant mRNA species in yeast (up to 0,8 % of total RNA), their transposition occurs at very low rate. Multiple regulators and their role in metabolism of Ty1 elements were indentified, but general mechanism regulating retrotransposition have not been described yet. We are particularly interested in the role of TRAMP complex in the process of retrotransposition. The TRAMP complex is responsible for nuclear RNA processing, surveillance and degradation and consists of the non-canonical poly(A) polymerase Trf4p/Trf5p, the Zn-knuckle protein Air1p/Air2p and the RNA helicase Mtr4p. The role of TRAMP complex is to target RNA substrate by adding oligo(A) tail and thus promoting its degradation by exosome, a multiprotein complex with 3´− 5´ exonuclease activity. It has been reported, that the levels of Ty1 sense and antisense transcripts  |9 eng 
650 0 7 |a kvasinky  |7 ph122058  |2 czenas 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a TRAMP komplex  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a Saccharomycetales  |2 eczenas 
650 0 9 |a Saccharomycetals  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF N-BCH BIOCH (BIOCH)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/211469/prif_m/ 
CAT |c 20120215  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120612  |l MUB01  |h 1130 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120718  |l MUB01  |h 1459 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20121015  |l MUB01  |h 1107 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130304  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1358 
CAT |c 20140127  |l MUB01  |h 1917 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140401  |l MUB01  |h 1457 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0757 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0801 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140829  |l MUB01  |h 1425 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0738 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0805 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0808 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1159 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1448 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0229 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0818 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161212  |l MUB01  |h 1547 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1608 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1614 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1622 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2033 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0151 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0208 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0734 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0739 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1436 
CAT |c 20200401  |l MUB01  |h 1257 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0958 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1946 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1212 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2356 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0002 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2020-04-01 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2012-K-8734  |5 3285005240  |8 20121025  |f 70  |f Prezenční  |r 20121025  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2012-K-8734  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD