The role of TRAMP complex in transposition of Ty1 elements in Saccharomyces cerevisiae
Ty1 transposony jsou mobilní genetické elementy kvasinek, které jsou strukturně i funkčně blízké retrovirům. K transposzici těchto elementů však dochází velmi zřídka, a to i přesto, že Ty1 RNA je jednou z nejhojnějších mRNA v buňce, kde tvoří až 0,8% celkové RNA. Dosud nebylo objasněno, jak buňka re...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2012
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/211469/prif_m/ |
| Shrnutí: | Ty1 transposony jsou mobilní genetické elementy kvasinek, které jsou strukturně i funkčně blízké retrovirům. K transposzici těchto elementů však dochází velmi zřídka, a to i přesto, že Ty1 RNA je jednou z nejhojnějších mRNA v buňce, kde tvoří až 0,8% celkové RNA. Dosud nebylo objasněno, jak buňka reguluje transpozici Ty1 elementů, ale bylo identifikováno mnoho kvasinkových genů účastnících se tohoto procesu. Cílem této práce bylo objasnění role komplexu TRAMP v transpozici Ty1 elementů. Tento komplex je zásadní komponentou kontroly kvality RNA v jádře kvasinek a skládá se z nekanonické poly(A) polymerasy Trf4/Trf5, zinkového proteinu Air1/Air2 a RNA helikasy Mtr4. TRAMP komplex je schopný rozpoznat vadnou molekulu RNA, označit jí oligo(A) koncem a tím umožnit její degradaci exosomem, makromolekulárním komplexem s 3´− 5´ exonukelasovou aktivitou. Bylo ukázáno, že delece TRF4 a TRF5 genů, jakožto i delece genu kódující exonukleasovou podjednotku exosomu, RRP6, způsobí narušení standardn Ty1 transposons are mobile genetic elements which are structurally and functionally related to retroviruses. Despite the fact that Ty1 RNA is one of the most abundant mRNA species in yeast (up to 0,8 % of total RNA), their transposition occurs at very low rate. Multiple regulators and their role in metabolism of Ty1 elements were indentified, but general mechanism regulating retrotransposition have not been described yet. We are particularly interested in the role of TRAMP complex in the process of retrotransposition. The TRAMP complex is responsible for nuclear RNA processing, surveillance and degradation and consists of the non-canonical poly(A) polymerase Trf4p/Trf5p, the Zn-knuckle protein Air1p/Air2p and the RNA helicase Mtr4p. The role of TRAMP complex is to target RNA substrate by adding oligo(A) tail and thus promoting its degradation by exosome, a multiprotein complex with 3´− 5´ exonuclease activity. It has been reported, that the levels of Ty1 sense and antisense transcripts |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová |
| Fyzický popis: | 47 l. : il. |