MAMA: an R Package for Meta-Analysis of MicroArray

Meta-analýza, ktorá kombinuje dáta z viacerých štúdií, je dôležitým nástrojom analýzy dát z microarray experimentov. Implementácia metód pre meta-analýzu je často nedostupná alebo poskytuje len niekoľko málo metód bez schopnosti vizualizovať a kombinovať výsledky z rozdielnych metód. Táto práca posk...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Ihnatová, Ivana (Autor práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2010
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/184415/prif_r/
Obálka
LEADER 03427ctm a22005297a 4500
001 MUB01000684489
003 CZ BrMU
005 20191212220401.0
008 110720s2010 xr |||||q|||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
040 |a BOD035  |b cze  |d BOD114 
072 7 |a 57/59  |x Biologické vědy  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 303.7  |2 MRF 
080 |a 57:51-7  |2 MRF 
080 |a 57/59  |2 MRF 
100 1 |a Ihnatová, Ivana  |% UČO 184415  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a MAMA: an R Package for Meta-Analysis of MicroArray  |h [elektronický zdroj] /  |c Ivana Ihnatová 
260 |c 2010 
300 |a 1 CD-ROM 
502 |a Rigorózní práce (RNDr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2010 
520 2 |a Meta-analýza, ktorá kombinuje dáta z viacerých štúdií, je dôležitým nástrojom analýzy dát z microarray experimentov. Implementácia metód pre meta-analýzu je často nedostupná alebo poskytuje len niekoľko málo metód bez schopnosti vizualizovať a kombinovať výsledky z rozdielnych metód. Táto práca poskytuje krátky popis a užívateľskú príručku pre nový R-balík MAMA. Balík obsahuje implementácie deviatich metód pre meta-analýzu microarray dát a ďalšie funkcie pre kombináciu výstupov a pre úpravu formátov jednak dátových súborov jednak výstupov metód. Balík je dostupný na CRAN.  |% cze 
520 2 9 |a Meta-analysis is a powerful tool for analyzing microarray experiments by combining data from multiple studies. Currently, the implementation of the methods of meta-analysis is often unavailable or offers only a few methods in one package without ability to visualize and combine results from different methods. This thesis provides a short description and user guide for a new package MAMA. The package contains implementation of nine various methods for meta-analysis of microarray data. Functionalities for combining outputs from different methods and for data transformation are also available in the package. The package is available on CRAN.  |9 eng 
650 0 7 |a analýza dat  |7 ph301326  |2 czenas 
650 0 7 |a mikročipová analýza  |2 czmesh 
650 0 9 |a data analysis  |2 eczenas 
650 0 2 |a Microarray Analysis 
655 7 |a rigorózní práce  |7 fd132407  |2 czenas 
655 9 |a doctoral dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biologie  |b Matematická biologie  |c PřF Rig-BI BIMA (BIMA)  |2 CZ-BrMU 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Přírodovědecká fakulta  |7 kn20010709281  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/184415/prif_r/ 
CAT |a VARTECKA  |b 02  |c 20110720  |l MUB01  |h 0826 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0150 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2028 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1252 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0205 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20191212  |l MUB01  |h 2204 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1311 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1207 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m CDROM  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 VV  |b KUK - volný výběr  |3 57.087.1-IHNA  |5 3285003817  |7 CD ROM si vyžádejte u knihovníka u výpůjčního pultu  |8 20110720  |f 70  |f Prezenční  |r 20110720  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - volný výběr  |d 57.087.1-IHNA  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j VV