MAMA: an R Package for Meta-Analysis of MicroArray
Meta-analýza, ktorá kombinuje dáta z viacerých štúdií, je dôležitým nástrojom analýzy dát z microarray experimentov. Implementácia metód pre meta-analýzu je často nedostupná alebo poskytuje len niekoľko málo metód bez schopnosti vizualizovať a kombinovať výsledky z rozdielnych metód. Táto práca posk...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2010
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/184415/prif_r/ |
| Shrnutí: | Meta-analýza, ktorá kombinuje dáta z viacerých štúdií, je dôležitým nástrojom analýzy dát z microarray experimentov. Implementácia metód pre meta-analýzu je často nedostupná alebo poskytuje len niekoľko málo metód bez schopnosti vizualizovať a kombinovať výsledky z rozdielnych metód. Táto práca poskytuje krátky popis a užívateľskú príručku pre nový R-balík MAMA. Balík obsahuje implementácie deviatich metód pre meta-analýzu microarray dát a ďalšie funkcie pre kombináciu výstupov a pre úpravu formátov jednak dátových súborov jednak výstupov metód. Balík je dostupný na CRAN. Meta-analysis is a powerful tool for analyzing microarray experiments by combining data from multiple studies. Currently, the implementation of the methods of meta-analysis is often unavailable or offers only a few methods in one package without ability to visualize and combine results from different methods. This thesis provides a short description and user guide for a new package MAMA. The package contains implementation of nine various methods for meta-analysis of microarray data. Functionalities for combining outputs from different methods and for data transformation are also available in the package. The package is available on CRAN. |
|---|---|
| Fyzický popis: | 1 CD-ROM |