Phylogeny of squirrels (Sciurus, Rodentia) based on supertrees reconstruction

Odkedy sa molekulárne dáta využívajú na stanovenie fylogenézy, vrámci skupiny stromových veveríc tribu Sciurini sa pojednáva o mnohých taxonomických nejasnostiach. Pracovala som s rozsiahlym molekulárnym materiálom, aby som stanovila fylogenetické vzťahy a odhalila, kde skupina vznikla. Použila som...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Pečnerová, Patrícia (Autor práce)
Další autoři: Martínková, Natália, 1976- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/324092/prif_b/
Obálka
LEADER 05949ctm a22008897a 4500
001 MUB01000683150
003 CZ BrMU
005 20140522133557.0
008 110701s2011 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)203976 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 59  |x Zoologie  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 599.322.2  |2 MRF 
080 |a 575.86:59  |2 MRF 
100 1 |a Pečnerová, Patrícia  |% UČO 324092  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Phylogeny of squirrels (Sciurus, Rodentia) based on supertrees reconstruction  |y eng 
245 1 0 |a Phylogeny of squirrels (Sciurus, Rodentia) based on supertrees reconstruction  |h [rukopis] /  |c Patrícia Pečnerová 
260 |c 2011 
300 |a 57 l. 
500 |a Vedoucí práce: Natália Martínková 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Odkedy sa molekulárne dáta využívajú na stanovenie fylogenézy, vrámci skupiny stromových veveríc tribu Sciurini sa pojednáva o mnohých taxonomických nejasnostiach. Pracovala som s rozsiahlym molekulárnym materiálom, aby som stanovila fylogenetické vzťahy a odhalila, kde skupina vznikla. Použila som mitochondriálne a jadrové DNA sekvencie, verejne dostupné, a pomocou Bayesiánskej analýzy a šiestich rôznych metód rekonštrukcie superstromov som určila fylogenézu veveríc tribu Sciurini. Zahrnutých bolo 17 druhov, ktoré reprezentovali všetky súčasne rozoznávané rody a rozsiahle geografické rozšírenie skupiny. Výsledky tejto práce podporili objavy súčasných molekulárnych štúdií. Namiesto piatich aktuálne rozoznávaných rodov boli v našej štúdii potvrdené iba dva a rod Sciurus bol parafyletický. Druhy rodov Microsciurus, Rheithrosciurus a Syntheosciurus sa objavili v líniach spolu s druhmi rodu Sciurus, pôvodne pridelená úroveň podrodov by bola pre tieto taxóny vhodnejšia. Navyše, superstromy  |% cze 
520 2 9 |a Since molecular data are used to infer phylogeny, many taxonomic ambiguities have been discussed in the group of tree squirrels of the tribe Sciurini. In this study, I worked with extensive published molecular material to establish phylogenetic relationships and discover where the tribe originated. I used mitochondrial and nuclear DNA sequences and through Bayesian analysis and six different methods of supertree reconstruction, I determined the phylogeny of Sciurini squirrels. A total of 17 included species represented all currently recognized genera and wide geographic distribution of the group. Results of this work supported findings of recent molecular studies. Instead of five currently recognized genera, only two of them were supported and the genus Sciurus was paraphyletic. Species of Microsciurus, Rheithrosciurus and Syntheosciurus occured in lineages with Sciurus species. Originally assigned subgeneric level of these taxa would be more appropriate. Furthermore, supertrees reveal  |9 eng 
650 0 7 |a fylogeneze živočichů  |7 ph137729  |2 czenas 
650 0 7 |a veverky  |7 ph260614  |2 czenas 
650 0 9 |a animal phylogeny  |2 eczenas 
650 0 9 |a animal physiology  |2 eczenas 
650 0 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
650 0 9 |a squirrels  |2 eczenas 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biologie  |b Systematická biologie a ekologie  |c PřF B-BI BISE (BISE)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Martínková, Natália,  |d 1976-  |7 xx0102115  |% UČO 103641  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav botaniky a zoologie  |7 olak2006333067  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/324092/prif_b/ 
CAT |c 20110701  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1249 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20131009  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0833 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0842 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0848 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0853 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140514  |l MUB01  |h 0856 
CAT |a KLEPPOVA  |b 02  |c 20140522  |l MUB01  |h 1335 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0733 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0748 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140528  |l MUB01  |h 0752 
CAT |a ANTLOVAX  |b 02  |c 20140627  |l MUB01  |h 1000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 0934 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1153 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141204  |l MUB01  |h 1204 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1325 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1328 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0203 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20190404  |l MUB01  |h 2040 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1308 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20200504  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20200504  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20200505  |l MUB01  |h 1800 
CAT |a SVERAKOVAX  |b 02  |c 20201117  |l MUB01  |h 2207 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 ZOOLO  |b Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |3 BP 29/2011  |5 3285006572  |4 DPČ: 29-11 -- BP  |8 20140522  |f 78  |f Mimo UK  |r 20140522  |s převod 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 ZOOLO  |b Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |3 BP 30/2011  |5 3285006573  |4 DPČ: 30-11 -- BP  |8 20140522  |f 78  |f Mimo UK  |r 20140522  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c Ústav botaniky a zoologie (ZOOLO)  |d BP 29/2011  |e available  |t K dispozici  |f 2  |g 0  |h N  |i 0  |j ZOOLO