Phylogeny of squirrels (Sciurus, Rodentia) based on supertrees reconstruction
Odkedy sa molekulárne dáta využívajú na stanovenie fylogenézy, vrámci skupiny stromových veveríc tribu Sciurini sa pojednáva o mnohých taxonomických nejasnostiach. Pracovala som s rozsiahlym molekulárnym materiálom, aby som stanovila fylogenetické vzťahy a odhalila, kde skupina vznikla. Použila som...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2011
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/324092/prif_b/ |
| Shrnutí: | Odkedy sa molekulárne dáta využívajú na stanovenie fylogenézy, vrámci skupiny stromových veveríc tribu Sciurini sa pojednáva o mnohých taxonomických nejasnostiach. Pracovala som s rozsiahlym molekulárnym materiálom, aby som stanovila fylogenetické vzťahy a odhalila, kde skupina vznikla. Použila som mitochondriálne a jadrové DNA sekvencie, verejne dostupné, a pomocou Bayesiánskej analýzy a šiestich rôznych metód rekonštrukcie superstromov som určila fylogenézu veveríc tribu Sciurini. Zahrnutých bolo 17 druhov, ktoré reprezentovali všetky súčasne rozoznávané rody a rozsiahle geografické rozšírenie skupiny. Výsledky tejto práce podporili objavy súčasných molekulárnych štúdií. Namiesto piatich aktuálne rozoznávaných rodov boli v našej štúdii potvrdené iba dva a rod Sciurus bol parafyletický. Druhy rodov Microsciurus, Rheithrosciurus a Syntheosciurus sa objavili v líniach spolu s druhmi rodu Sciurus, pôvodne pridelená úroveň podrodov by bola pre tieto taxóny vhodnejšia. Navyše, superstromy Since molecular data are used to infer phylogeny, many taxonomic ambiguities have been discussed in the group of tree squirrels of the tribe Sciurini. In this study, I worked with extensive published molecular material to establish phylogenetic relationships and discover where the tribe originated. I used mitochondrial and nuclear DNA sequences and through Bayesian analysis and six different methods of supertree reconstruction, I determined the phylogeny of Sciurini squirrels. A total of 17 included species represented all currently recognized genera and wide geographic distribution of the group. Results of this work supported findings of recent molecular studies. Instead of five currently recognized genera, only two of them were supported and the genus Sciurus was paraphyletic. Species of Microsciurus, Rheithrosciurus and Syntheosciurus occured in lineages with Sciurus species. Originally assigned subgeneric level of these taxa would be more appropriate. Furthermore, supertrees reveal |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Natália Martínková |
| Fyzický popis: | 57 l. |