Optimalizace protilátek pro použití v chromatinové imunoprecipitaci

Telomery jsou nukleoproteinové struktury nezbytné pro udržení integrity eukaryotických genomů. Telomery jsou chráněny celou řadou interagujících proteinů. Jedním z těchto proteinů vážících se na telomerické repetice in vitro je protein AtTRB1, který obsahuje na N-konci Myb-like doménu typu telobox,...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Vychodilová, Ivona (Autor práce)
Další autoři: Procházková Schrumpfová, Petra, 1978- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2011
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/324085/prif_b/
Obálka
LEADER 05160ctm a22007577a 4500
001 MUB01000682528
003 CZ BrMU
005 20200415133536.0
008 110628s2011 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
035 |a (ISMU-VSKP)212196 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112  |2 MRF 
080 |a 616-097.3  |2 MRF 
080 |a 576.316-024.522  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Vychodilová, Ivona  |% UČO 324085  |4 dis 
242 1 0 |a Antibody optimalisation for chromatin immunoprecipitation  |y eng 
245 1 0 |a Optimalizace protilátek pro použití v chromatinové imunoprecipitaci  |h [rukopis] /  |c Ivona Vychodilová 
260 |c 2011 
300 |a 51 l. :  |b il. 
500 |a Vedoucí práce: Petra Procházková Schrumpfová 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Telomery jsou nukleoproteinové struktury nezbytné pro udržení integrity eukaryotických genomů. Telomery jsou chráněny celou řadou interagujících proteinů. Jedním z těchto proteinů vážících se na telomerické repetice in vitro je protein AtTRB1, který obsahuje na N-konci Myb-like doménu typu telobox, centrální GH1/GH5 doménu a coiled-coil doménu na C-konci. Stále není jasná přesná lokalizace proteinu AtTRB1 v rámci rostlinného genomu. Chromatinová imunoprecipitace je in vitro metoda umožňující pomocí specifických protilátek analyzovat cílovou sekvenci DNA a tak nám může poskytnout informaci o interakci proteinu AtTRB1. V rámci této bakalářské práce se podařilo získat dostatečné množství vhodného materiálu a zavést metody izolace jader. Hlavním tématem studie byla optimalizace protilátek anti-AtTRB1: 1.2, 4.1, 5.2, 6.2 vyvinutých v naší laboratoři. Nejvhodnější protilátkou pro ChIP je protilátka anti-AtTRB1 1.2. Protilátku 4.1 se nepodařilo optimalizovat. Protilátka 5.2 není vhodná pro ...  |% cze 
520 2 9 |a Telomeres are nucleoprotein structures that maintain the integrity of eukaryotic genomes. Telomeres are protected by a number of interacting proteins. One of these proteins binding to telomeric repeats in vitro is AtTRB1 protein containing the N-terminal Myb-like domain type telobox, GH1/GH5 central domain and coiled-coil domain at the C-terminus. The AtTRB1 protein localization is still not quite clear within the plant genome. Chromatin immunoprecipitation is in vitro method which enables the use of specific antibodies to analyze the targeted DNA sequence and thus can provide information on the interaction of protein AtTRB1. In this bachelor thesis we have managed to gain enough material to isolate nuclei for ChIP. The main theme of the study was the optimization of anti-AtTRB1 antibodies: 1.2, 4.1, 5.2, and 6.2. The most suitable antidote for ChIP is anti-AtTRB1 1.2. The optimization of the antibody 4.1 was not successful. The antibody 5.2 is not suitable for ChIP, because in ...  |9 eng 
650 0 7 |a AtTRB proteiny  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a chromatinová imunoprecipitace  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a monoklonální protilátky  |7 ph265700  |2 czenas 
650 0 7 |a telomery  |7 ph966298  |2 czenas 
650 0 9 |a monoclonal antibodies  |2 eczenas 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a telomeres  |2 eczenas 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Procházková Schrumpfová, Petra,  |d 1978-  |7 mub2011661494  |% UČO 12987  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/324085/prif_b/ 
CAT |c 20110628  |l MUB01  |h 0423 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110826  |l MUB01  |h 0812 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110923  |l MUB01  |h 1440 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20110927  |l MUB01  |h 0820 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20111005  |l MUB01  |h 0016 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0149 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120426  |l MUB01  |h 1106 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2027 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20130211  |l MUB01  |h 1151 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1248 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140911  |l MUB01  |h 1059 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1146 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1447 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1409 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0202 
CAT |a CERVINKOVX  |b 02  |c 20160920  |l MUB01  |h 2018 
CAT |c 20191220  |l MUB01  |h 1306 
CAT |a STODULKOVA  |b 02  |c 20200415  |l MUB01  |h 1335 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0954 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1943 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1206 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230309  |l MUB01  |h 1401 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-12-20 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2011-K-8379  |5 3285003796  |8 20110826  |f 70  |f Prezenční  |r 20110826  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2011-K-8379  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD