Optimalizace protilátek pro použití v chromatinové imunoprecipitaci
Telomery jsou nukleoproteinové struktury nezbytné pro udržení integrity eukaryotických genomů. Telomery jsou chráněny celou řadou interagujících proteinů. Jedním z těchto proteinů vážících se na telomerické repetice in vitro je protein AtTRB1, který obsahuje na N-konci Myb-like doménu typu telobox,...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2011
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/324085/prif_b/ |
| Shrnutí: | Telomery jsou nukleoproteinové struktury nezbytné pro udržení integrity eukaryotických genomů. Telomery jsou chráněny celou řadou interagujících proteinů. Jedním z těchto proteinů vážících se na telomerické repetice in vitro je protein AtTRB1, který obsahuje na N-konci Myb-like doménu typu telobox, centrální GH1/GH5 doménu a coiled-coil doménu na C-konci. Stále není jasná přesná lokalizace proteinu AtTRB1 v rámci rostlinného genomu. Chromatinová imunoprecipitace je in vitro metoda umožňující pomocí specifických protilátek analyzovat cílovou sekvenci DNA a tak nám může poskytnout informaci o interakci proteinu AtTRB1. V rámci této bakalářské práce se podařilo získat dostatečné množství vhodného materiálu a zavést metody izolace jader. Hlavním tématem studie byla optimalizace protilátek anti-AtTRB1: 1.2, 4.1, 5.2, 6.2 vyvinutých v naší laboratoři. Nejvhodnější protilátkou pro ChIP je protilátka anti-AtTRB1 1.2. Protilátku 4.1 se nepodařilo optimalizovat. Protilátka 5.2 není vhodná pro ... Telomeres are nucleoprotein structures that maintain the integrity of eukaryotic genomes. Telomeres are protected by a number of interacting proteins. One of these proteins binding to telomeric repeats in vitro is AtTRB1 protein containing the N-terminal Myb-like domain type telobox, GH1/GH5 central domain and coiled-coil domain at the C-terminus. The AtTRB1 protein localization is still not quite clear within the plant genome. Chromatin immunoprecipitation is in vitro method which enables the use of specific antibodies to analyze the targeted DNA sequence and thus can provide information on the interaction of protein AtTRB1. In this bachelor thesis we have managed to gain enough material to isolate nuclei for ChIP. The main theme of the study was the optimization of anti-AtTRB1 antibodies: 1.2, 4.1, 5.2, and 6.2. The most suitable antidote for ChIP is anti-AtTRB1 1.2. The optimization of the antibody 4.1 was not successful. The antibody 5.2 is not suitable for ChIP, because in ... |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Petra Procházková Schrumpfová |
| Fyzický popis: | 51 l. : il. |