Studium konformačního chování peptidů metodami molekulového modelování

Předložená práce diskutuje množství dostupných informací o struktuře, konformačních fluktuacích a interkonverzích monomerních, oligomerních a fibrilárních Aβ species a v návaznosti aplikuje metody molekulového modelování ke konformačnímu studiu dynamiky sekvenčně odlišných Aβ monomerních peptidů, li...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Klusák, Jiří (Autor práce)
Další autoři: Kříž, Zdeněk, 1970- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2010
Témata:
Alzheimerova choroba
amyloid β-peptid
analýza sekundárních struktur
molekulární dynamika
molekulové modelování
neurodegenerativní onemocnění
peptidy
Alzheimer's disease
amyloid β-peptide
molecular dynamics
molecular modelling
neurodegenerative diseases
peptids
secondary structure analysis
bakalářské práce
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/211504/prif_b/
Obálka
LEADER 07539ctm a22013217a 4500
001 MUB01000670387
003 CZ BrMU
005 20200416114025.0
008 110221s2010 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-11-27 
035 |a (ISMU-VSKP)186820 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112.5/.6  |2 MRF 
080 |a 616.8-003.8  |2 MRF 
080 |a 616.831-003.8  |2 MRF 
080 |a 616.892/.894  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Klusák, Jiří  |% UČO 211504  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Conformational behavior study of peptides using molecular modeling methods  |y eng 
245 1 0 |a Studium konformačního chování peptidů metodami molekulového modelování  |h [rukopis] /  |c Jiří Klusák 
260 |c 2010 
300 |a 65 l. 
500 |a Vedoucí práce: Zdeněk Kříž 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2011 
520 2 |a Předložená práce diskutuje množství dostupných informací o struktuře, konformačních fluktuacích a interkonverzích monomerních, oligomerních a fibrilárních Aβ species a v návaznosti aplikuje metody molekulového modelování ke konformačnímu studiu dynamiky sekvenčně odlišných Aβ monomerních peptidů, lidského Aβ(1-42)hum a mutantního Aβ(1-42)mut, v solventu s variabilní iontovou silou, včetně reverzní sekvence Aβ(1-42)rev. Molekulově dynamické simulace Aβ(1-42)hum a Aβ(1-42)mut odhalily velice stabilní α-helikální region mezi residui Tyr10 (resp. Phe10) a Ala21, nacházející se v hydrofobním centru obou monomerních peptidů, bez ohledu na iontovou sílu prostředí. C-terminální konec Aβ(1-42)mut vykazuje v důsledku zvýšené četnosti 310-helikálních konformací nižší flexibilitu než Aβ(1-42)hum. V C-terminální oblasti Aβ(1-42)hum peptidu v solventu s nulovou, v menší míře i fyziologickou, iontovou silou byly pozorovány krátké β-sheety, vykazující velmi nízkou stabilitu. Torzní analýzou byla ...  |% cze 
520 2 9 |a Presented thesis summarizes current state of knowledge in structure, conformational fluctuations and interconversions of monomeric, oligomeric and fibrilar Aβ species. In order to determine conformational behaviour of monomeric Aβ, molecular modeling methods were applied, focusing on molecular dynamics simulation of human Aβ(1-42)hum and mutated Aβ(1-42)mut peptide in explicit solvent with different ionic strength. In addition, simulations of reversed Aβ(1-42) sequence were performed. It has been found very stable α-helical region, spaning residues 10 to 21, within central hydrophobic core of both Aβ(1-42)hum and Aβ(1-42)mut peptides. In comparison with human Aβ(1-42), Aβ(1-42)mut C-terminal end shows increased abundance of 310-helical elements and thus lesser flexibility. Small metastable β-sheets located near the C-end of Aβ(1-42)hum in 0 ionic strength (and in lesser content also in physiological conditions) were found. Torsion analysis revealed higher propensity of C-terminal resid...  |9 eng 
650 0 7 |a Alzheimerova choroba  |7 ph117324  |2 czenas 
650 0 7 |a amyloid β-peptid  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a analýza sekundárních struktur  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a molekulární dynamika  |7 ph202577  |2 czenas 
650 0 7 |a molekulové modelování  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a neurodegenerativní onemocnění  |7 ph123254  |2 czenas 
650 0 7 |a peptidy  |7 ph115712  |2 czenas 
650 0 9 |a Alzheimer's disease  |2 eczenas 
650 0 9 |a amyloid β-peptide  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a molecular dynamics  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular modelling  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a neurodegenerative diseases  |2 eczenas 
650 0 9 |a peptids  |2 eczenas 
650 0 9 |a secondary structure analysis  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Kříž, Zdeněk,  |d 1970-  |7 xx0068636  |% UČO 2703  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/211504/prif_b/ 
CAT |c 20110221  |l MUB01  |h 0428 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1921 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2330 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110817  |l MUB01  |h 1615 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110818  |l MUB01  |h 1101 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20110923  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0146 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130304  |l MUB01  |h 1214 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140417  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1332 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140428  |l MUB01  |h 1349 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1319 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1126 
CAT |c 20150703  |l MUB01  |h 1139 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1446 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1407 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0731 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1342 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |c 20191127  |l MUB01  |h 1404 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0848 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1210 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1133 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1958 
CAT |a FIALOVA  |b 02  |c 20200416  |l MUB01  |h 1140 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1125 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0514 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0952 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1941 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1203 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0025 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0035 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2337 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2019-11-27 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2010-K-8352  |5 3285003778  |8 20110818  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20110818  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2010-K-8352  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD 

Podobné jednotky