Studium substrátové specifity halogenalkan dehalogenáz metodou virtuálního screeningu
Virtuální screening je důležitou metodou umožňující hledání nových biologicky aktivních látek na základě předpovědi jejich vazby s receptorem s využitím počítačového programu. Tato práce je zaměřena na mapování současných postupů, předpokladů a limitací jednotlivých metod v této oblasti. Vyzdviženy...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2009.
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/211165/prif_b/ |
| LEADER | 05319ctm a22008417a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000588787 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20140124110607.0 | ||
| 008 | 090625s2009 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2018-08-31 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)172121 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 577.1 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Daniel, Lukáš |% UČO 211165 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Investigation of substrate specificity of haloalkane dehalogenase by virtual screening |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Studium substrátové specifity halogenalkan dehalogenáz metodou virtuálního screeningu |h [rukopis] / |c Lukáš Daniel. |
| 260 | |c 2009. | ||
| 300 | |a 48 l. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Jiří Damborský. | ||
| 502 | |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2009. | ||
| 520 | 2 | |a Virtuální screening je důležitou metodou umožňující hledání nových biologicky aktivních látek na základě předpovědi jejich vazby s receptorem s využitím počítačového programu. Tato práce je zaměřena na mapování současných postupů, předpokladů a limitací jednotlivých metod v této oblasti. Vyzdviženy jsou důležité kroky ve výběru struktury receptoru, sady testovaných látek a modelování ligand-receptorového komplexu. Metody virtuálního screeningu byly prakticky aplikovány na enzym halogenalkan dehalogenázu DhaA. Celkově bylo vybráno a virtuálně „testováno“ 974 molekul. Bylo zjištěno, že nejméně 16 molekul se potenciálně lépe váže do aktivního centra enzymu než známé substráty. Budou-li výsledky screeningu potvrzeny experimentálně, rozšíří nalezené ligandy substrátovou specifitu DhaA enzymu o zcela nové třídy molekul. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Virtual screening is an important platform used for the search of new biologically active compounds. This search is based on the prediction of their binding affinity with a target receptor, using computer programs. This thesis critically reviews current concepts, assumptions and limitation of individual methods in this field. Important steps in the selection of receptor structure and a set of tested ligands, as well as procedure of modeling ligand-receptor complex are discussed. Docking-based virtual screening methods have been applied to the enzyme haloalkane dehalogenase DhaA. This enzyme receptor was screened against 974 molecules. At least 16 of screend ligands have a potential of better binding to the active site than the well-known active ligands. The newly discovered substrates, if confirmed experimentally, will broaden the substrate specificity of DhA by the new classes of molecules. |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a halogenalkandehalogenasa |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a virtuální screening |2 CZ-BrMU |
| 655 | 7 | |a bakalářské práce |7 fd132403 |2 czenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Biochemie |c PřF B-BCH BCHM (BCHM) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Damborský, Jiří, |d 1969- |7 mzk2006348900 |% UČO 1441 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/211165/prif_b/ |
| CAT | |c 20090625 |l MUB01 |h 0451 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20090923 |l MUB01 |h 1549 | ||
| CAT | |a VASICEK |b 02 |c 20091020 |l MUB01 |h 1126 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091102 |l MUB01 |h 0715 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091103 |l MUB01 |h 0211 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 0232 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 1915 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20091219 |l MUB01 |h 0815 | ||
| CAT | |c 20100428 |l MUB01 |h 1013 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20100501 |l MUB01 |h 1215 | ||
| CAT | |a PUTNOVAX |b 02 |c 20100908 |l MUB01 |h 1249 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20100929 |l MUB01 |h 0335 | ||
| CAT | |c 20110627 |l MUB01 |h 1916 | ||
| CAT | |c 20110627 |l MUB01 |h 2325 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20110719 |l MUB01 |h 1325 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0126 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120412 |l MUB01 |h 0944 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120412 |l MUB01 |h 0947 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 1947 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20121001 |l MUB01 |h 1055 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130303 |l MUB01 |h 1110 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130925 |l MUB01 |h 1019 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130925 |l MUB01 |h 1137 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140107 |l MUB01 |h 1228 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20140124 |l MUB01 |h 1105 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20140124 |l MUB01 |h 1106 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1444 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1405 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0022 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160829 |l MUB01 |h 1628 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170502 |l MUB01 |h 1655 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170731 |l MUB01 |h 1711 | ||
| CAT | |c 20180831 |l MUB01 |h 1055 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0939 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1928 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1147 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20230920 |l MUB01 |h 0942 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240703 |l MUB01 |h 0129 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2018-08-31 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2009-K-7355 |5 3285002310 |8 20091020 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20091020 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2009-K-7355 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||