Diferenční gelová elektroforéza (2-D DIGE) a její využití v onkologické proteomice

2-D DIGE je metodou značení komplexních proteinových směsí fluorescenčními barvami před jejich následnou separací pomocí dvourozměrné gelové elektroforézy, usnadňující detekci a kvantifikaci separovaných proteinů. Tato technologie byla aplikována na membránové frakce buněk HFs a CARs infikovaných čt...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Váňová, Dominika (Autor práce)
Další autoři: Bouchal, Pavel, 1975- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2009.
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/211376/prif_b/
Obálka
LEADER 07373ctm a22013097a 4500
001 MUB01000588382
003 CZ BrMU
005 20091021093905.0
008 090623s2009 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-08-31 
035 |a (ISMU-VSKP)172157 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.1  |2 MRF 
080 |a 578.825  |2 MRF 
080 |a 577  |2 MRF 
100 1 |a Váňová, Dominika  |% UČO 211376  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Differential gel electrophoresis (2-D DIGE) and its application in oncological proteomics  |y eng 
245 1 0 |a Diferenční gelová elektroforéza (2-D DIGE) a její využití v onkologické proteomice  |h [rukopis] /  |c Dominika Váňová. 
260 |c 2009. 
300 |a 44 l. 
500 |a Vedoucí práce: Pavel Bouchal. 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2009. 
520 2 |a 2-D DIGE je metodou značení komplexních proteinových směsí fluorescenčními barvami před jejich následnou separací pomocí dvourozměrné gelové elektroforézy, usnadňující detekci a kvantifikaci separovaných proteinů. Tato technologie byla aplikována na membránové frakce buněk HFs a CARs infikovaných čtyřmi různými viry a virovými vektory (HCMV Merlin, RCMV 1149 (ΔUL141), RAd587 (UL141), RAd592 (CTRL)), které se lišily v obsahu genu UL141. Jednotlivé proteinové vzorky byly označeny kyanidovými barvami (Cy2, Cy3 a Cy5), smíchány dohromady a separovány na 2-DE gelech. Směsné vzorky značené barvou Cy2 byly použity jako tzv. interní standardy. Po 2-DE byl každý vzorek zvlášť naskenován a vizualizován díky rozdílným excitačním a emisním vlnovým délkám kyanidových barev. Pomocí speciálního počítačového programu PDQUEST byly dále identifikovány rozdíly v proteinové expresi mezi jednotlivými vzorky.  |% cze 
520 2 9 |a 2-D DIGE is a method for labelling complex protein mixture with fluorescent dyes prior to their subsequent two-dimensional gel electrophoresis separation, which simplifies the process of detecting and quantifying separated proteins. This technique was applied to membrane fractions from HFs and CARs cells infected by four viruses and viral vectors (HCMV Merlin, RCMV 1149 (ΔUL141), RAd587 (UL141), RAd592 (CTRL)), that differed in gene UL141. Individual protein samples were labeled by cyanine dyes (Cy2, Cy3 and Cy5), mixed together and separated on 2-DE gels. Mixed samples labeled by Cy2 served as internal standard. After 2-DE protein separation, each of the gel was scanned and visualized independently by selecting the individual excitation and emission wavelengths for each cyanine dye. Differences in protein expression between samples were identified by using PDQUEST software. Our effort was particularly focused on detection of two membrane proteins, CD155 and CD112.  |9 eng 
650 0 7 |a diferenční gelová elektroforéza  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a lidský cytomegalovirus  |7 ph184818  |2 czenas 
650 0 7 |a modulace imunitního systému hostitele  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a onkologická proteomika  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a 2-D DIGE  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a human cytomegalovirus  |2 eczenas 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Bouchal, Pavel,  |d 1975-  |7 xx0128495  |% UČO 8757  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/211376/prif_b/ 
CAT |c 20090623  |l MUB01  |h 0451 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20091021  |l MUB01  |h 0939 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091102  |l MUB01  |h 0714 
CAT |a BATCH-UPD  |b 02  |c 20091103  |l MUB01  |h 0210 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 0232 
CAT |c 20091203  |l MUB01  |h 1914 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20091219  |l MUB01  |h 0815 
CAT |c 20100428  |l MUB01  |h 1013 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100501  |l MUB01  |h 1215 
CAT |a BATCH-UPD  |b 00  |c 20100929  |l MUB01  |h 0335 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20110502  |l MUB01  |h 1005 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110503  |l MUB01  |h 0902 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 1916 
CAT |c 20110627  |l MUB01  |h 2325 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20110713  |l MUB01  |h 1602 
CAT |a batch  |b 00  |c 20120324  |l MUB01  |h 0126 
CAT |c 20120610  |l MUB01  |h 1946 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20120710  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20120919  |l MUB01  |h 0940 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20130303  |l MUB01  |h 1109 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140424  |l MUB01  |h 0832 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1640 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140430  |l MUB01  |h 1645 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0923 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0924 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140507  |l MUB01  |h 0929 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0800 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140513  |l MUB01  |h 0803 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20140804  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0737 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20140924  |l MUB01  |h 0741 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0804 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141111  |l MUB01  |h 0808 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1444 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1404 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0022 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0815 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20160802  |l MUB01  |h 0817 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160829  |l MUB01  |h 1630 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170727  |l MUB01  |h 1507 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180801  |l MUB01  |h 1526 
CAT |c 20180831  |l MUB01  |h 1055 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1606 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1613 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1622 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1814 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2020 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2033 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0146 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0151 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0207 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0734 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0738 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0741 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0745 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0748 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1155 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1435 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210204  |l MUB01  |h 1234 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 0939 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1928 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1147 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20211115  |l MUB01  |h 1141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2359 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0002 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0017 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-08-31 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-2009-K-7364  |5 3285002334  |8 20091021  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20091021  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-2009-K-7364  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD