Průkaz signifikantních artefaktů v séru metodou SELDI TOF MS a optimalizace přípravy biologického materiálu pro metodu SELDI TOF MS
Ke studiu preanalytického vlivu sérových aditiv v moderním odběrovém systému byla v proteomické studii použita metoda SELDI TOF MS. Krev byla odebírána do dvou typů zkumavek: Microvette Sarstedt typ “Neutral” a Sarstedt “Sérum Gel +Aktivátor srážení”. Metoda: Sérum bylo analyzováno použitím Cipherge...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2007
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/12251/prif_r/ |
| LEADER | 05848ctm a22008537a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01000554042 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20160505144220.0 | ||
| 008 | 080626s2007 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2017-06-28 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)141986 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD002 | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 543.51 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.112.01:575.111 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Pilný, Radomír |% UČO 12251 |* [absolvent PřírF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Surface-Enhanced Laser Desorption Ionization/Time-of-Flight Mass Spectrometry Reveals Significant Artifacts in Serum Obtained from Clot Activator-Containing Collection Device and optimizing of biological sample of preparation for SELDI TOF MS analysis |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Průkaz signifikantních artefaktů v séru metodou SELDI TOF MS a optimalizace přípravy biologického materiálu pro metodu SELDI TOF MS |h [rukopis] / |c Radomír Pilný |
| 260 | |c 2007 | ||
| 300 | |a 36 l. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Dalibor Valík | ||
| 502 | |a Rigorózní práce (RNDr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2008 | ||
| 520 | 2 | |a Ke studiu preanalytického vlivu sérových aditiv v moderním odběrovém systému byla v proteomické studii použita metoda SELDI TOF MS. Krev byla odebírána do dvou typů zkumavek: Microvette Sarstedt typ “Neutral” a Sarstedt “Sérum Gel +Aktivátor srážení”. Metoda: Sérum bylo analyzováno použitím Ciphergen SELDI/TOF IMAC30-Cu ProteinChip array. Výsledky: Ve spektrech bylo zjištěno 34 skupin píků v rozsahu 3000 - 20000 m/z. Z toho se 26 píků vyskytovalo ve více než 50 % spekter. Ve skupině Sérum Gel Aktivátor srážení jsme detekovali 2 píky s m/z 3957.3 a 4283.6, které měly signifikantně zvýšenou intenzitu která při srovnání průměru normalizovaných ploch píku byla 40x větší ve srovnávané skupině „Neutral“. Závěr: Na základě těchto zjištění ve skupině s aktivátorem srážení byly provedeny změny v odběru vzorku pro klinickou biochemii, kde se nyní používá plazma a pro imunochemii se používají prázdné zkumavky. Alikvoty z těchto prázdných zkumavek se dlouhodobě uchovávají pro prospektivní proteom |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Background: To study preanalytical influences of serum additives used in modern blood collection systems on proteomic studies using SELDI/MALDI/TOF mass spectrometry. Methods: Blood was collected into two types of tubes: Microvette Sarstedt type “Neutral” and Sarstedt “Serum Gel Clotting Activator”. Serum was analyzed using Ciphergen SELDI/TOF IMAC30-Cu ProteinChip array. Results. Thirty four peak clusters were generated from within the mass range 3000 - 20000 m/z. Out of these, 26 peaks occurred in more than 50% of spectra. In the Serum Gel Clooting Activator group we detected two peaks with m/z 3957.3 and 4283.6 displaying grossly increased peak intensities whose average normalized peak areas were more than 40-fold higher comparing with the “Neutral” groups. Conclusions. Due to gross artifacts observed in the clot activator arm, blood collection system was reconfigured to the use of plasma in clinical chemistry and plain serum for immunoassay and long-term serum banking for prospec |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a hmotnostní spektrometrie |7 ph120763 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a proteomika |7 ph347581 |2 czenas |
| 650 | 0 | 9 | |a mass spectroscopy |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a proteomics |2 eczenas |
| 655 | 7 | |a rigorózní práce |7 fd132407 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a doctoral dissertations |2 eczenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Biochemie |c PřF Rig-BCH BIOCH (BIOCH) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Valík, Dalibor |7 xx0061177 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Přírodovědecká fakulta. |b Chemická sekce |7 ko2006315818 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/12251/prif_r/ |
| CAT | |a VASICEK |b 02 |c 20080626 |l MUB01 |h 0959 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20081021 |l MUB01 |h 0603 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091102 |l MUB01 |h 0648 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 02 |c 20091103 |l MUB01 |h 0150 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 0213 | ||
| CAT | |c 20091203 |l MUB01 |h 1856 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20091219 |l MUB01 |h 0757 | ||
| CAT | |c 20100428 |l MUB01 |h 1010 | ||
| CAT | |a BATCH-UPD |b 00 |c 20100501 |l MUB01 |h 1156 | ||
| CAT | |a batch |b 00 |c 20120324 |l MUB01 |h 0115 | ||
| CAT | |c 20120610 |l MUB01 |h 1926 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20120919 |l MUB01 |h 0754 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130205 |l MUB01 |h 1545 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20130303 |l MUB01 |h 1013 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20130730 |l MUB01 |h 1201 | ||
| CAT | |c 20140127 |l MUB01 |h 1846 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20140610 |l MUB01 |h 0817 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20141030 |l MUB01 |h 0733 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1047 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151225 |l MUB01 |h 2336 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160504 |l MUB01 |h 1630 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160505 |l MUB01 |h 1442 | ||
| CAT | |c 20170628 |l MUB01 |h 1109 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20180828 |l MUB01 |h 0808 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191204 |l MUB01 |h 1120 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20191204 |l MUB01 |h 1127 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20200323 |l MUB01 |h 1954 | ||
| CAT | |a FUKSOVAX |b 02 |c 20200916 |l MUB01 |h 1115 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 0932 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1921 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1138 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20210819 |l MUB01 |h 1748 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220324 |l MUB01 |h 1928 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20220811 |l MUB01 |h 2145 | ||
| CAT | |c 20240209 |l MUB01 |h 1157 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2017-06-28 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-2007-K-3395 |5 3285000202 |8 20080626 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20080626 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-2007-K-3395 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||