Vliv způsobu přípravy vzorku na MALDI MS profil vybraných bakterií
MALDI-TOF MS se jeví jako potenciální nástroj pro rychlou a spolehlivou identifikaci bakterií. Vzorek čisté bakteriální kultury se smíchá s matricí a nanese na MALDI destičku. Po zaschnutí se analyzuje. Celková doba procesu od odběru vykultivovaných bakterií až po jejich identifikaci se pohybuje kol...
Uloženo v:
Hlavní autor: | |
---|---|
Další autoři: | |
Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
Jazyk: | Čeština |
Vydáno: |
2008.
|
Témata: | |
On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/175123/prif_b/ |
Shrnutí: | MALDI-TOF MS se jeví jako potenciální nástroj pro rychlou a spolehlivou identifikaci bakterií. Vzorek čisté bakteriální kultury se smíchá s matricí a nanese na MALDI destičku. Po zaschnutí se analyzuje. Celková doba procesu od odběru vykultivovaných bakterií až po jejich identifikaci se pohybuje kolem deseti minut, což je hlavní výhodou metody. S MALDI-TOF MS bývají poměrně běžně rozlišeny bakterie na rodové a druhové úrovni. Dokonce ani rozlišení bakterií na kmenového úrovni už není zcela výjimkou. Teoretická část bakalářské práce nastiňuje různé postupy a možnosti při přípravě vzorku a matrice. Zároveň je pozornost věnována dosaženým výsledkům. Praktická část se zaměřuje na pozorování vlivu matrice a metody nanášení na kvalitu spekter a možnost automatizace analýzy. V poslední části je testována schopnost MALDI-MS rozlišit vybraný soubor bakterií na kmenové úrovni. MALDI-TOF MS seems to be a potential tool for fast and reliable bacteria identification. Bacteria are sampled from colonies on an agar plate, mixed with MALDI matrix, air-dried, and introduced into the mass spectrometer for analysis. The overall time of the procedure from cultivated bacteria sampling to its identification takes about 10 minutes, which appears to be the main advantage of the method. Using MALDI-TOF MS one can differentiate bacteria on the genus and species levels. Even the differentiation of the bacteria at the strain level is not an exception today. Theoretical part of the bachelor thesis outlines various procedures for sample and matrix preparation. At the same time the author pays also attention to the achieved results. Experimental part focuses on research of the matrix influence and sample preparation methods on the quality of the spectra and the possibility of analysis automation. The last part is devoted to the tests of the MALDI-MS ability to differentiate selec. |
---|---|
Popis jednotky: | Vedoucí práce: Ondrej Šedo. |
Fyzický popis: | 40 l. : il., obr. |