Apoptotický protein BAX - analýza nábojové distribuce /
V této bakalářské práci jsem se zaměřila na podrobný mechanismus apoptózy, programované buněčné smrti. Klíčovou pozici v tomto procesu zaujímá rodina BCL-2 proteinů, konkrétně protein BAX, který je zodpovědný za změnu propustnosti vnější mitochondriální membrány. Bylo zjištěno, že jeho aktivace a in...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2018
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/z3obe/ |
| Shrnutí: | V této bakalářské práci jsem se zaměřila na podrobný mechanismus apoptózy, programované buněčné smrti. Klíčovou pozici v tomto procesu zaujímá rodina BCL-2 proteinů, konkrétně protein BAX, který je zodpovědný za změnu propustnosti vnější mitochondriální membrány. Bylo zjištěno, že jeho aktivace a inhibice má vliv na nábojovou distribuci v rámci jeho struktury. Proto jsem se ve své práci zaměřila na analýzu a porovnávání nábojové distribuce v různých strukturách BAX proteinu. Z databáze Protein Data Bank jsem získala struktury aktivovaného proteinu BAX, inhibovaného proteinu BAX a komplexů proteinu BAX. S pomocí webové aplikace Atomic Charge Calculator jsem vypočítala parciální atomové náboje na těchto strukturách, a následně jsem porovnávala nábojovou distribuci ve skupinách BAX struktur se sekvenční a strukturní podobností. Analýza nábojové distribuce nám umožnila popis a objasnění mechanismu aktivace, inhibice a akce proapoptotického proteinu BAX. / V tejto bakalárskej práci som sa z In this bachelor thesis, I studied detailed mechanism of apoptosis, programmed cell death. The BCL-2 family of proteins, especially BAX, plays a key role in controlling outer mitochondrial membrane permeabilization. It was determined, that activation and inhibition of this protein have an influence on his charge distribution. For this reason, in my bachelor thesis, I focused on analysis and comparison of charge distribution in different BAX structures. I obtained structures of activated protein BAX, inhibited protein BAX and BAX protein complexes from a database Protein Data Bank. Using a web application AtomicChargeCalculator, I computed partial atomic charges and subsequently, compared charge distribution of these structures within groups of BAX structures, having structural and sequence similarities. Results of this work showed, that charge distribution analysis helps us to describe and clarify the mechanism of activation, inhibition, and action of proapoptotic protein BAX. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Radka Svobodová Vařeková |
| Fyzický popis: | 59 listů |