Implementace metod MGC a OGC pro výpočet parciálních atomových nábojů /

V této bakalářské práci se věnujeme výpočtům a využití parciálních atomových nábojů. Výpočet těchto nábojů je možný buď kvantově mechanickými metodami, které jsou přesnější ale časově náročnější nebo pomocí empirických metod, které jsou rychlejší, ale obsahují výrazně větší míru aproximací. Empirick...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Zouvala, Šimon (Autor práce)
Další autoři: Svobodová Vařeková, Radka, 1977- (Vedoucí práce), Raček, Tomáš (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2018
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/jb4h2/
Obálka
LEADER 05776ctm a22008777i 4500
001 MUB01006420680
003 CZ BrMU
005 20200703214143.0
008 180621s2018 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-12-17 
035 |a (ISMU-VSKP)310290 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 54  |x Chemie. Mineralogické vědy  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 54-123  |2 MRF 
080 |a 168.52  |2 MRF 
100 1 |a Zouvala, Šimon  |% UČO 445475  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Implementation of MGC and OGC methods for calculation of partial atomic charges  |y eng 
245 1 0 |a Implementace metod MGC a OGC pro výpočet parciálních atomových nábojů /  |c Šimon Zouvala 
264 0 |c 2018 
300 |a ix, 39 listů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2018 
520 2 |a V této bakalářské práci se věnujeme výpočtům a využití parciálních atomových nábojů. Výpočet těchto nábojů je možný buď kvantově mechanickými metodami, které jsou přesnější ale časově náročnější nebo pomocí empirických metod, které jsou rychlejší, ale obsahují výrazně větší míru aproximací. Empirické metody dále dělíme na ty, které se snaží reprodukovat náboje z kvantové mechaniky a na ty, které definují náboje vlastním způsobem. Příkladem druhé skupiny těchto empirických metod jsou Molecular graph charge (MGC) a Orbital graph charge (OGC), jejichž implementace je zahrnuta v této práci. MGC a OGC jsou založeny na principech teorie elektrických obvodů. Pracují s molekulou pouze jako topologickým objektem, využívají teorii grafů pro své výpočty a konkrétní souřadnice jednotlivých atomů neberou v potaz. Vrcholy grafu znázorňuje MGC jako atomy a OGC jako valenční elektrony, hrany znázorňují obě metody jako vazby. Implementace obou metod byla úspěšná, metody vykazují vysokou korelaci s kvan  |% cze 
520 2 9 |a In this bachelor thesis we deal with calculations and application of partial atomic charges. The calculation of these charges is possible by quantum-mechanical methods, which are more accurate but time-consuming, or by empirical methods that are faster but contain a larger approximation. We divide the empirical methods into those that try to reproduce the charges of quantum mechanics and those that define the charges in their own way. An example of a second group of these empirical methods is Molecular Graph Charge (MGC) and Orbit Graph Graph (OGC), whose implementation is included in this thesis. MGC and OGC are based on the theory of electrical circuits. They work with the molecule only as a topological object, they use the graphs theory for their calculations, and the specific coordinates of individual atoms do not take into account. The graph vertices represent MGC as atoms and OGC as valence electrons, the edges are shown by both methods as bonds. The implementation of both method  |9 eng 
650 0 7 |a disociační konstanta  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a empirické vědy  |7 ph119927  |2 czenas 
650 0 7 |a parciální atomové náboje  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a dissociation constant  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a empirical sciences  |2 eczenas 
650 0 9 |a partial atomic charges  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Chemoinformatika a bioinformatika  |c PřF B-BCH CHI (CHI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Svobodová Vařeková, Radka,  |d 1977-  |7 mub2010609307  |% UČO 4056  |4 ths 
700 1 |a Raček, Tomáš  |% UČO 324965  |* [PřírF MU]  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/jb4h2/ 
CAT |c 20180621  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180826  |l MUB01  |h 1416 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20181121  |l MUB01  |h 1140 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20181121  |l MUB01  |h 1142 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20181212  |l MUB01  |h 1611 
CAT |c 20181217  |l MUB01  |h 1102 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1817 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2022 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0153 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0736 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0743 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0750 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200703  |l MUB01  |h 2130 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200703  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20210131  |l MUB01  |h 1332 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1029 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2015 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1303 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240202  |l MUB01  |h 2101 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2018-12-17 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-16090  |5 3285016205  |8 20181121  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20181121  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-16090  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD