Studium leukemických kmenových buněk pomocí dropletové digitální PCR a sekvenování nové generace (NGS), nové strategie pro studium na úrovni jedné buňky a vzácných populací /
Chronická myeloidní leukémie je nádorové onemocnění krvetvorby vyvolané přítomností fúzního onkoproteinu BCR-ABL1. V mé práci jsem se zaměřila na možnost využití metody digitální PCR pro detekci BCR-ABL1 transkriptu u pacientů s chronickou myeloidní leukémií pro sledování postupu léčby. Standardně j...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2018
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/l50ex/ |
| LEADER | 06591ctm a22010697i 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01006420251 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20250303101422.0 | ||
| 008 | 180619s2018 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2018-12-17 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)297567 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 |e rda | ||
| 072 | 7 | |a 577 |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 616.155.392 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.212.3 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Králová, Natálie |7 mzk20251254471 |% UČO 394314 |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Leukemic stem cell analysis by droplet digital PCR and next generation sequencing (NGS), new strategies for stydying single cells and rare populations |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Studium leukemických kmenových buněk pomocí dropletové digitální PCR a sekvenování nové generace (NGS), nové strategie pro studium na úrovni jedné buňky a vzácných populací / |c Natálie Králová |
| 264 | 0 | |c 2018 | |
| 300 | |a 55 listů | ||
| 336 | |a text |b txt |2 rdacontent | ||
| 337 | |a bez média |b n |2 rdamedia | ||
| 338 | |a svazek |b nc |2 rdacarrier | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: Marianna Romžová | ||
| 502 | |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2018 | ||
| 520 | 2 | |a Chronická myeloidní leukémie je nádorové onemocnění krvetvorby vyvolané přítomností fúzního onkoproteinu BCR-ABL1. V mé práci jsem se zaměřila na možnost využití metody digitální PCR pro detekci BCR-ABL1 transkriptu u pacientů s chronickou myeloidní leukémií pro sledování postupu léčby. Standardně je hladina BCR-ABL1 stanovována pomocí kvantitativní PCR, ale přináší s sebou nevýhody, jako je špatná reprodukovatelnost, obtížná standardizace mezi laboratořemi a nízká citlivost při měření limitních hladin. Dále jsem se zaměřila na optimalizaci protokolu pro co nejsenzitivnější detekci mutací v kinázové doméně BCR-ABL1, které bývají příčinou rezistence na tyrozinkinázové inhibitory a následného selhání léčby. V rámci testování digitální PCR jsme porovnávali dva systémy - dropletovou (QX200 Droplet dPCR System) a čipovou (QuantStudio 3D dPCR System) digitální PCR. U obou systémů jsme pro určení funkčnosti a citlivosti stanovovali míru falešné pozitivity, limit blanku a limit detekce; pro mě |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Chronic myeloid leukemia is a cancer of the blood due to the presence of fusion onkoprotein BCR ABL1. In my thesis, I focused on possibility of using digital PCR method for detection of BCR ABL1 transcript in patients with chronic myeloid leukemia for treatment monitoring. By default, the BCR ABL1 transcript is evaluated by quantitative PCR. Its disadvantages are poor reproductibility, difficult standardisation between laboratories and low sensitivity. I aimed to optimise protocol for more sensitive detection of mutations in BCR ABL1 kinase domain, which are the cause of resistance to tyrosine kinase inhibitors and subsequent failure. We compared two digital PCR testing - QX200 Droplet dPCR System and QuantStudio 3D dPCR System. False positive rate, limit of blank and limit of detection was used for both systems functionality and sensitivity. For measurements of QS3D was used 20 BCR - ABL1 - negative samples (15 healthy controls, 5 negative) and fror QX200 was used 80 BCR - ABL1 - |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a BCR-ABL1 |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a ddPCR |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a digitální PCR |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a dPCR |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a dropletová digitální PCR |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a filadelfský chromozom |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a fúzní geny |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a chronická myeloidní leukemie |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a chronická myeloidní leukémie |7 ph138393 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a kinázová doména |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a mutace kinázové domény |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a NGS |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a Sangerovo sekvenování |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a sekvenování nové generace |7 ph884101 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a TKI |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 7 | |a tyrozinkinázové inhibitory |2 CZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a digital PCR |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a droplet digital PCR |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a fusion genes |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a chronic myeloid leukemia |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a kinase domain mutations |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a kinase domain |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a next generation sequencing |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a Sanger sequencing |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 9 | |a tyrosine-kinase inhibitors |2 eCZ-BrMU |
| 650 | 0 | 2 | |a Leukemia, Myelogenous, Chronic, BCR-ABL Positive |
| 650 | 0 | 2 | |a Philadelphia Chromosome |
| 655 | 7 | |a diplomové práce |7 fd132022 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a master's theses |2 eczenas | |
| 658 | |a Biochemie |b Analytická biochemie |c PřF N-BCH ANBI (ANBI) |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Romžová, Miroslava |7 xx0079092 |% UČO 239123 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav biochemie |7 ko2015866760 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/l50ex/ |
| CAT | |c 20180619 |l MUB01 |h 0421 | ||
| CAT | |a FOLTYNOVA |b 02 |c 20181116 |l MUB01 |h 1356 | ||
| CAT | |c 20181217 |l MUB01 |h 1102 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 1816 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2022 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2034 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190105 |l MUB01 |h 2143 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0148 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0153 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190126 |l MUB01 |h 0209 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0735 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0740 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0743 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0746 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190307 |l MUB01 |h 0750 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1139 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1143 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1156 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20190521 |l MUB01 |h 1437 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1029 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 2015 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1303 | ||
| CAT | |a VACOVAX |b 02 |c 20220425 |l MUB01 |h 1010 | ||
| CAT | |c 20240209 |l MUB01 |h 1158 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240604 |l MUB01 |h 2355 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240605 |l MUB01 |h 0000 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20240605 |l MUB01 |h 0003 | ||
| CAT | |a VACOVAX |b 02 |c 20250303 |l MUB01 |h 1014 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2018-12-17 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-16085 |5 3285016200 |8 20181116 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20181116 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-16085 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||