Novel approaches towards electroanalysis of natural and modified DNAs and their interactions /
Tato disertační práce obsahuje komentáře šesti odborných prací publikovaných v impaktovaných elektroanalytických časopisech a zmiňuje dva dosud nepublikované projekty. Předkládané výsledky prezentují nové poznatky o elektrochemii přirozené a modifikované DNA, včetně nových aplikací. (1) Nová metod u...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2018
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/glwmo/ |
| Shrnutí: | Tato disertační práce obsahuje komentáře šesti odborných prací publikovaných v impaktovaných elektroanalytických časopisech a zmiňuje dva dosud nepublikované projekty. Předkládané výsledky prezentují nové poznatky o elektrochemii přirozené a modifikované DNA, včetně nových aplikací. (1) Nová metod umožňující studium DNA-protein interakcí, nazvaná elektrochemický „footprinting“, je založená na reakci mezi enzymaticky zařazenou bází značenou azidofenylovou skupinou a fenyl- nebo nitrofenylacetylénem. Tato „click“ reakce nemůže proběhnout v případě, že je azidofenylem modifikovaná báze překrytá DNA-vázajícím proteinem. Z rozdílu mezi signály poskytovanými značkami před a po „click“ reakci je možno odvodit informace o interakci DNA a proteinu. (2) Byla vyvinuta nenákladná technika pro rychlou detekci přítomnosti PCR produktů. Metoda je založená na enzymatické inkorporaci cytosinu značeného biotinem během PCR. Analýza přítomnosti PCR produktu (a tedy zprostředkovaně hledané sekvence ve ... This dissertation includes commentary of six studies published in electroanalytical peer reviewed journals and mentions two yet unpublished projects. Presented results provide new insights on electrochemistry of natural and modified DNA, including new analytical applications. (1) A new method of electrochemical analysis of DNA-protein interactions, named electrochemical “footprinting”, has been developed. The method is based on the reaction between site specific enzymatically introduced azidophenyl-modified bases and phenyl- or nitrophenylacetylene. When sequences containing the azidophenyl modifications are covered by DNA-binding protein, reaction with phenyl- or nitrophenylacetylene cannot occur. Information about DNA-protein interaction can be deduced from the difference between the signals of DNA labels before and after click reaction. (2) Simple, low cost and fast protocol for detection of PCR products is presented. The method is based on incorporation of biotin labeled cytosine ... |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Luděk Havran |
| Fyzický popis: | 124 stran |