Study of nucleolar reorganization in embryonic stem cells /

Tato disertační práce je zaměřená na analýzu jadérka a jeho restrukturalizaci u myších embryonálních kmenových buňek. Věnuje se jak odpovědi kmenových buněk na poškození ribozomálních genů, tak na analýzu epigenomu repetic ribozomálních genů. V první části práce je charakterizována morfologie jadére...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Franek, Michal (Autor práce)
Další autoři: Bártová, Eva, 1968- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/357550/prif_d/
Obálka
Popis
Shrnutí:Tato disertační práce je zaměřená na analýzu jadérka a jeho restrukturalizaci u myších embryonálních kmenových buňek. Věnuje se jak odpovědi kmenových buněk na poškození ribozomálních genů, tak na analýzu epigenomu repetic ribozomálních genů. V první části práce je charakterizována morfologie jadérek a jaderných “speckles”u kmenových buněk. Morfologie je studována především pomocí imunobarvení jadérkových markerů a specifického barvení jadérka pomocí AgNO3. Morphologie jadérka je studována u neovlivněných buněk a buněk u kterých byla inhibována aktivita RNA polymerázy I a II. Dále byla sledována morfologie buněk, ve kterých byly indukovány dvouřetězcové zlomy pomocí endonukleázy I-PpoI. Druhá část práce pokračuje detailnejší analýzou odpovědi kmenových buněk na specifickou indukci DNA lézí v oblasti ribozomálních genů. Biochemické metody jako imunoprecipitace proteinů a chromatinová imunoprecipitace dále analyzují roli epigenetiky v procesu opravy DNA zlomů a reorganizace jadérkového
My thesis is aimed at the reorganization of the nucleolus in the context of mouse embryonic stem cells. It is focused on the response of mESCs to DNA lesions located in ribosomal genes and on the epigenetic changes in rRNA repeats which are linked to this response. First part of the work analyses morphological changes in the nucleolus and nuclear speckles during reorganization. Morphology of nucleolus is analysed by immunofluorescence staining of different nucleolar markers as well as by traditional Ag-NOR staining of agrophylic proteins. Changes in the nucleolar morphology are monitored upon treatment with inhibitors of RNA polymerase I and II as well as after induction of double-strand breaks using I-PpoI endonuclease. Second part of my work tries to analyse the response of mESCs to DNA damage in nucleolar context in more detail. In support of immunofluorescence experiments are biochemical methods such as protein immunoprecipitation and chromatin immunoprecipitation that help identif
Popis jednotky:Vedoucí práce: Eva Bártová
Fyzický popis:98 stran