Sekvenční analýza genomů Treponema pallidum subsp. pallidum izolovaných z klinického materiálu /
Úvod. Syfilis je onemocnění, které způsobuje bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA), a které může vést k celkové systémové infekci lidského těla. Prevalence syfilis v posledních desítkách let stoupá, a to i přes existenci efektivní léčby, a celosvětová incidence dosahuje až 10 milionů pří...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2017
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/270498/lf_d/ |
| Shrnutí: | Úvod. Syfilis je onemocnění, které způsobuje bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA), a které může vést k celkové systémové infekci lidského těla. Prevalence syfilis v posledních desítkách let stoupá, a to i přes existenci efektivní léčby, a celosvětová incidence dosahuje až 10 milionů případů ročně. TPA není možno studovat pomocí klasických mikrobiologických přístupů, protože tato bakterie není kultivovatelná in vitro. Avšak revoluční techniky označované jako „culture-independent enrichment techniques“ otevírají novou kapitolu ve výzkumu treponem, neboť umožnují analyzovat genetickou informaci TPA bakterií izolovaných přímo z pacientů, a to bez nutnosti multiplikace těchto bakterií v experimentálních zvířatech. Metody. V rámci studie bylo na klinické vzorky aplikováno několik „culture-independent enrichment” technik, zahrnující “Anti-Treponemal Antibody Enrichment Sequencing” (ATAES), mechanickou mikromanipulaci, selektivní lyzi buněk, hybridizaci na oligonukleotidových DNA čipech. Introduction. Syphilis is a bacterial infection causing system damage to the body through the dissemination of the agent Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA). Despite the availability of effective treatment, last few decades have witnessed a dramatic global re-emergence of syphilis, with annual worldwide incidence reaching more than 10 million. TPA cannot be studied using traditional microbiological approaches since this bacterium cannot be cultivated under in vitro conditions. However, the culture-independent enrichment of treponemal DNA in syphilis clinical samples opened a new chapter in Treponema research by enabling to obtain genetic data of TPA bacteria isolated directly from the patients, without the need of multiplication of TPA strains in experimental animals. Methods. Several approaches of culture-independent enrichment of TPA were applied to syphilis clinical samples including Anti-Treponemal Antibody Enrichment Sequencing (ATAES), mechanical micromanipulation, enrichment based on selective cell type lysis. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: David Šmajs |
| Fyzický popis: | 153 listů |