Charakterizace alternativních sekvenčních motivů vXC-bohaté telomerní DNA /

Tato práce se zabývá studiem telomerních sekvencí DNA a sekundárních struktur DNA, které dané sekvence mohou vytvářet. Konkrétně se jedná o alternativní sekvence, které jsou pozorovány ve vyšší míře u ALT (alternativní prodlužování telomer) linie rakovinových buněk, které jsou dávány do kontrastu s...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Krafčík, Daniel (Autor práce)
Další autoři: Trantírek, Lukáš, 1975- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/408708/prif_m/
Obálka
LEADER 05072ctm a22007217i 4500
001 MUB01006394913
003 CZ BrMU
005 20171005104511.0
008 170620s2017 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-10-08 
035 |a (ISMU-VSKP)298257 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD004  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 576.316-024.522  |2 MRF 
080 |a (043)378.2  |2 MRF 
100 1 |a Krafčík, Daniel  |% UČO 408708  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Characterization of alternative sequence variants in C-rich telomeric DNA  |y eng 
245 1 0 |a Charakterizace alternativních sekvenčních motivů vXC-bohaté telomerní DNA /  |c Daniel Krafčík 
264 0 |c 2017 
300 |a 70 stran, 13 stran nečíslovaných příloh 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Lukáš Trantírek 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2017 
520 2 |a Tato práce se zabývá studiem telomerních sekvencí DNA a sekundárních struktur DNA, které dané sekvence mohou vytvářet. Konkrétně se jedná o alternativní sekvence, které jsou pozorovány ve vyšší míře u ALT (alternativní prodlužování telomer) linie rakovinových buněk, které jsou dávány do kontrastu s kanonickým telomerním šest nukleotidovým opakujícím se segmentem v C-bohatém řetězci (TAACCC)n. Cílem této práce je zjistit, zda některé změny bází v jedné z pozic tohoto segmentu, přirozeně zastoupeném u ALT linií buněk, ovlivní přirozené formování tetraplexové sekundární struktury, tzv. i-motivu, a popřípadě určit o jakou novou sekundární strukturu se jedná. Pro studium těchto sekvencí jsou vybrány nativní polyakrylamidová gelová elektroforéza, UV/CD spektroskopie, NMR spektroskopie a smFRET. V případě pozitivního výsledku by získaná data mohla v budoucnosti pomoci při cílené léčbě rakovinných onemocnění, které využívají ALT proces pro bujení. ví  |% cze 
520 2 9 |a This work is aimed on studying telomeric sequences of DNA and higher order secondary structures of DNA which may arise from them. Specifically, alternative sequences, found in higher extent in ALT (Alternative Lengthening of Telomeres) cancer cell lines, are studied and put in contrast to canonical telomeric six nucleotide repeating segment from C-rich telomeric strand (TAACCC)n. Main goal of this work is to find out if any replacements of bases in one of the six positions of this segment, which are commonly present in ALT line of cells, may affect naturally formed tetraplex secondary structure, so called i-motif, and possibly identify what is the new higher order secondary structure. Gel electrophoresis, UV/CD spectroscopy, NMR spectroscopy and smFRET are biophysical techniques chosen to study these sequences. In the case of positive results, obtained data could help in the future in targeted treatment of cancers using ALT pathway as a process of proliferation.  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a telomery  |7 ph966298  |2 czenas 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a telomeres  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Fyzika  |b Biofyzika  |c PřF N-FY BF (BF)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Trantírek, Lukáš,  |d 1975-  |7 xx0129019  |% UČO 8725  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav fyziky kondenzovaných látek  |7 mub20211110271  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/408708/prif_m/ 
CAT |c 20170620  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a RACLAVSKA  |b 02  |c 20170704  |l MUB01  |h 1628 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0002 
CAT |a JANA  |b 02  |c 20171005  |l MUB01  |h 1037 
CAT |a JANA  |b 02  |c 20171005  |l MUB01  |h 1045 
CAT |c 20171008  |l MUB01  |h 1001 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190108  |l MUB01  |h 0005 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 2345 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20201014  |l MUB01  |h 1051 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201102  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210224  |l MUB01  |h 2247 
CAT |a DRIMLOVAX  |b 02  |c 20210413  |l MUB01  |h 0912 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1024 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2011 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1254 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221017  |l MUB01  |h 0015 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2349 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230808  |l MUB01  |h 2146 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231216  |l MUB01  |h 0107 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240707  |l MUB01  |h 2135 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-10-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 PRIF  |a Přírodovědecká fakulta  |2 PRVFY  |b ÚK volný výběr - F  |3 K-F-2017-KRAF  |5 3145370725  |8 20170704  |f 70  |f Prezenční  |q 20180810  |r 20170114  |s dar 
AVA |a SCI50  |b PRIF  |c ÚK volný výběr - F  |d K-F-2017-KRAF  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j PRVFY