Rozpoznávání křížových struktur v DNA a jejich analýza in silico /

Křížové struktury patří mezi sekundární struktury DNA. Často se vyskytují v promotorech genů, kde s proteiny regulují nejrůznější buněčné procesy. Existuje několik rodin proteinů, které se vážou spíše na strukturu DNA než na specifické cílové sekvence. Tyto proteiny se dále podílí na opravách DNA, m...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Morávek, Michal (Autor práce)
Další autoři: Brázda, Václav, 1970- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/436489/prif_b/
Obálka
LEADER 05168ctm a22009137i 4500
001 MUB01006394841
003 CZ BrMU
005 20171109090645.0
008 170620s2017 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-11-13 
035 |a (ISMU-VSKP)288123 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 575.113  |2 MRF 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
100 1 |a Morávek, Michal  |% UČO 436489  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Recognition of cruciform structures in DNA and its in silico analysis  |y eng 
245 1 0 |a Rozpoznávání křížových struktur v DNA a jejich analýza in silico /  |c Michal Morávek 
264 0 |c 2017 
300 |a 40 stran 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Václav Brázda 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2017 
520 2 |a Křížové struktury patří mezi sekundární struktury DNA. Často se vyskytují v promotorech genů, kde s proteiny regulují nejrůznější buněčné procesy. Existuje několik rodin proteinů, které se vážou spíše na strukturu DNA než na specifické cílové sekvence. Tyto proteiny se dále podílí na opravách DNA, modelování chromatinu, regulace transkripce, regulace replikace DNA a dalších aktivitách v buňce.V této bakalářské práci jsou detekovány sekundární struktury v DNA, konkrétně křížové struktury, pomocí nukleáz S1 a ScaI. Dále byla snaha detekovat tyto struktury i štěpením pomocí Nd3+ iontů. Sekvence schopné tvorby křížových struktur byly zároveň analyzovány i pomocí volně dostupné webové aplikace Palindrom finder.  |% cze 
520 2 9 |a Cruciforms belongs to DNA secondary structures. They are often present in promoters of genes, where they regulate various cellular processes. There are several protein families that bind to DNA structures rather than to specific target sequences. These proteins take part in DNA repair, remodeling of chromatin, transcription regulation, replication regulation and more.In this bachelor thesis I try to detect secondary DNA structures, specifically cruciforms, by S1 and ScaI nucleases. Further there was effort to detect these structures by DNA cleavage by Nd3+ ions. Sequences capable of forming cruciforms were analyzed by freely accessible web application Palindrom finder.  |9 eng 
650 0 7 |a DNA (nukleová kyselina)  |7 ph116977  |2 czenas 
650 0 7 |a geny  |7 ph120499  |2 czenas 
650 0 7 |a chromatin  |2 czmesh 
650 0 7 |a křížová struktura DNA  |2 czmesh 
650 0 9 |a deoxyribonucleic acid  |2 eczenas 
650 0 9 |a genes  |2 eczenas 
650 0 2 |a DNA, Cruciform 
650 0 2 |a Chromatin 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Brázda, Václav,  |d 1970-  |7 nlk20010096077  |% UČO 15548  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/436489/prif_b/ 
CAT |c 20170620  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170727  |l MUB01  |h 1508 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170817  |l MUB01  |h 0928 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170920  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20171109  |l MUB01  |h 0906 
CAT |c 20171113  |l MUB01  |h 0946 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1609 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1615 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1623 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1816 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0152 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0735 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0743 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0750 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210204  |l MUB01  |h 2057 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1024 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2011 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1254 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230313  |l MUB01  |h 1621 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231027  |l MUB01  |h 2116 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-11-13 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-15104  |5 3285014706  |8 20171109  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20171109  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-15104  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD