Evoluční aspekty horizontálního genového přenosu u rostlin /
V tejto dizertačnej práci se venujeme horizontálnemu génovému prenosu génu kódujúceho mikimopínsyntázu (mis gén) z donora Agrobacterium rhizogenes na recipientov - druhy vrámci rastlinných rodov Linaria a Nicotiana. mis gén je súčasťou prenášanej časti plazmidu T-DNA, ktorý sa nachádza v patogénnych...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2017
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/71975/prif_d/ |
| Shrnutí: | V tejto dizertačnej práci se venujeme horizontálnemu génovému prenosu génu kódujúceho mikimopínsyntázu (mis gén) z donora Agrobacterium rhizogenes na recipientov - druhy vrámci rastlinných rodov Linaria a Nicotiana. mis gén je súčasťou prenášanej časti plazmidu T-DNA, ktorý sa nachádza v patogénnych a symbiotických kmeňoch Agrobacteria, jeho úlohou je syntetizovať agrobacterium-špecifické nutrienty (mikimopíny) v bunkách hostiteľa. Prostredníctvom in silico analýz sekvencií mis génov, získaných z databáz i izolovaných v laboratóriu, sme ukázali tri možné osudy vývoja novonadobudnutého mis génu rastlinnými recipientami. V prípade rodu Linaria mis gén krátko po začlenení začal degenerovať a vývíja sa pod neutrálnymi selekčnými tlakmi. Situáciu v druhoch rodu Nicotiana je iná. N. glauca má zachovaný čítací rámec, mis gén je naďalej transkripčne aktívny a pôsobia naň silné selekčné tlaky. Táto situácia značí prospešný charakter zisku bakteriálneho mis génu a jeho domestikáciu či neofunkcio In this thesis we study the horizontal gene transfer (HGT) of gene coding mikimopine synthase (mis gene) from Agrobacterium rhizogenes to recipients - species within plant genera Linaria and Nicotiana. mis gene is a part of agrobacterial T-DNA plasmid. The role of mis gene is to synthesize agrobactrium-specific nutrients inside of host cells. Using in silico analyses of mis gene sequences, gained from databases or via detection and amplification in wet lab, we show three possible fates of the mis gene evolution after HGT event. In the case of genus Linaria, mis gene started to degenerate shortly after the incorporation into the plant genome. The fate of mis gene among Nicotiana species is different. mis gene of N. glauca has untouched open reading frame, is transcriptionally active, and is evolving under strong selective pressure. mis gene probably possesses some benefitial effects for N. glauca, is beeing domesticated, and/or maybe is beeing neofunctionalized. mis gene within the geno |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Bohuslav Janoušek |
| Fyzický popis: | 85 listů |