Funkční analýza mutací zodpovědných za vznik primárních imunodeficiencí /
Úvod Genetické varianty mohou být neškodné i škodlivé, přičemž ty škodlivé často podmiňují závažná lidská onemocnění včetně primárních imunodeficiencí (PID). Rozpoznání škodlivých variant není vždy jednoduchou záležitostí, protože řada z nich neovlivňuje přímo funkční produkt genu (například kódujíc...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2016
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/77720/lf_d/ |
| Shrnutí: | Úvod Genetické varianty mohou být neškodné i škodlivé, přičemž ty škodlivé často podmiňují závažná lidská onemocnění včetně primárních imunodeficiencí (PID). Rozpoznání škodlivých variant není vždy jednoduchou záležitostí, protože řada z nich neovlivňuje přímo funkční produkt genu (například kódující sekvenci proteinu), ale spíše nepřímo narušuje regulaci exprese. Nejčastějším typem takových „regulačních“ defektů vedoucích k onemocněním člověka jsou poruchy sestřihu pre-mRNA. I tyto aberace však zůstávají často nerozpoznané, zřejmě proto, že regulátory sestřihu mívají velmi degenerované sekvence vyskytující se po celé délce genu. I v případě, že jsou varianty vedoucí k poruchám sestřihu rozpoznány, posouzení jejich vlivu na finální podobu sestřihu a tedy na funkci produktu genu není triviální. Tato práce zkoumá prevalenci mutací ovlivňujících sestřih pre-mRNA u genů spojených se vznikem PID a u několika dalších genů. Dále prozkoumává možnosti rozpoznání těchto mutací a odhadu jejich vlivu na výslednou podobu sestřihu. Background Gene variants can be both innoxious and deleterious, the later ones often underlying serious human diseases including primary immunodeficiencies (PIDs). The recognition of the deleterious variants is not always straightforward, as they may not affect the gene function directly (e.g. its protein coding potential), but rather indirectly by disturbing its expression regulation. The most prevalent 'regulatory' defect leading to human disorders is pre-mRNA splicing aberration. Yet even the splicing-affecting variants can be many times unrecognised, as the splicing regulators are highly degenerate and dispersed all over the whole gene. Even when recognised, neither the assessment of the aberrant splicing consequences and its impact on gene function is a simple task. Therefore, this work inspects the prevalence of splicing-affecting mutations in the genes related to the PIDs development as well as in several other genes, explores the ways to recognize such mutations and to assess their impact on splicing pattern and proposes some novel mechanisms leading to aberrant splicing. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Tomáš Freiberger |
| Fyzický popis: | 136 listů |