Structural studies of regulatory protein domains involved in eukaryotic transcription /
RNA polymeráza II (RNAPII) je eukaryotický multidoménový enzym zodpovědný za transkripci genů kódujících a nekódujících proteiny. Jednou z domén RNAPII je flexibilní C-terminální doména (CTD), jež slouží k interakci se specifickými proteinovými faktory, které regulují transkripci. CTD se skládá z ta...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2017
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/113840/prif_d/ |
| Shrnutí: | RNA polymeráza II (RNAPII) je eukaryotický multidoménový enzym zodpovědný za transkripci genů kódujících a nekódujících proteiny. Jednou z domén RNAPII je flexibilní C-terminální doména (CTD), jež slouží k interakci se specifickými proteinovými faktory, které regulují transkripci. CTD se skládá z tandemových opakování konsenzuální sekvence tyrozin1-serine2-prolin3-threonin4-serine5- prolin6-serin7 (Y1S2P3T4S5P6S7). CTD je dynamickým způsobem post-translačně modifikována, čímž získává charakteristické interakční značky. Tyto značky jsou následně rozpoznávány specifickými faktory v souvislosti s fází transkripčního cyklu. Pochopení detailů, které určují interakce s CTD na molekulární úrovni je klíčové pro rozluštění funkce hustého regulačního systému při kontrole genové exprese. Předkládaná disertační práce je uvedena teoretickým přehledem struktury RNAPII a dosavadním mechanistickém poznání vlivu RNAPII na transkripční procesy. Úvod je doplněn shrnutím strukturních studií interakce ... RNA polymerase II (RNAPII) is a eukaryotic multisubunit enzyme responsible for transcription of protein coding and non-coding genes. RNAPII uses its long and flexible C-terminal domain (CTD) to recruit specific protein/RNA-binding factors for regulation of transcription. The CTD consists of tandem repeats of the heptapeptide consensus tyrosine1-serine2-proline3-threonine4-serine5-proline6- serine7 (Y1S2P3T4S5P6S7). The CTD sequence is post-translationally modified in a dynamic manner, yielding specific patterns that are recognized by appropriate factors in coordination with the transcription cycle events. To determine how protein/RNA-binding factors assemble and exchange on the CTD of RNAPII has remained a major challenge. Revealing these molecular details is key to understanding of regulatory networks involved in the regulation of gene expression. The thesis begins with a theoretical overview of RNAPII structure and mechanistic knowledge behind the transcription process. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Richard Štefl |
| Fyzický popis: | 194 stran |