Celogenomová sekvenace, anotace a komparativní genomika tří serovarů Salmonella enterica /
Salmonella enterica je významnou, celosvětově rozšířenou patogenní bakterií, kterou se ročně nakazí odhadem až 21 milionu lidí, z nichž přes 200 tisíc na následky onemocnění umírá. Díky proměnlivé antigenní struktuře tvoří přes 2500 různých sérovarů, které se liší v hostitelích, ve schopnosti virule...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2017
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | Elektronická verze přístupná pouze pro studenty a pracovníky MU |
| Shrnutí: | Salmonella enterica je významnou, celosvětově rozšířenou patogenní bakterií, kterou se ročně nakazí odhadem až 21 milionu lidí, z nichž přes 200 tisíc na následky onemocnění umírá. Díky proměnlivé antigenní struktuře tvoří přes 2500 různých sérovarů, které se liší v hostitelích, ve schopnosti virulence, patogeneze nebo v úniku před imunitním systémem hostitele. Pro maximální snížení nákazy lidí salmonelou jsou vyvíjeny vakcíny k očkování hospodářských zvířat, především kuřat, z nichž se salmonela nejčastěji dostává do potravinářství. Předmětem této práce byly tři salmonelové sérovary - Enteritidis, Infantis a Typhimurium, z nichž byly v laboratořích Výzkumného veterinárního ústavu v Brně připraveny deleční mutanti za účelem vývoje očkovací vakcíny pro kuřata. V této práci byly pomocí nástrojů komparativní genomiky ověřeny a potvrzeny předpokládané delece genů lon, fljB, fliC a salmonelového ostrova patogenity 1 v mutantních kmenech. Jednitlivé genomy byly anotovány a spolu se 17 genomy Salmonella enterica is an important ubiquitous pathogenic bacterium, which annually infects about 21 million people. Over 200 thousand of them die due to disease caused Salmonella. Salmonella has very variable antigenic structure, which leads to more than 2500 different Salmonella's serotypes. These serotypes differ in hosts, in virulence, pathogenesis or in defense against host immune system. To minimize incidence of Salmonella in human population, there are developed vaccines for farm animals, especially for chickens as a main initiators of Salmonella in food. Salmonella's serovars - Enteritidis, Typhimurium and Infantis were the main objects of this thesis. Three deletion mutants were developed in the labs od Veterinary Research Institute in Brno for the chicken vaccines designing. In this work were expected gene deletion of lon, fljB, fliC and Salmonella pathogenicity island 1 in mutant strains validated and confirmed by using the tools of comparative genomics. Each genome has been |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Darina Čejková |
| Fyzický popis: | 51 listů : ilustrace |