Axinový interaktom: charakterizace transientních interakcí axinu za pomocí peptidových knihoven /

Axin je scaffold protein, hrající důležitou roli v několika buněčných signálních drahách. Schopnost Axinu interagovat s různými signálními proteiny nemusí být důležitá jenom pro přenos signálu v rámci jedné kaskády, ale také pro komunikaci a přepínání mezi jednotlivými drahami. Cílem mojí diplomové...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Divišová, Eva (Autor práce)
Další autoři: Trantírek, Lukáš, 1975- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/379463/prif_m/
Obálka
LEADER 05683ctm a22008777i 4500
001 MUB01006385069
003 CZ BrMU
005 20170217110611.0
008 170211s2017 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-03-13 
035 |a (ISMU-VSKP)270484 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.122  |2 MRF 
100 1 |a Divišová, Eva  |% UČO 379463  |* [absolvent PřirF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Use of peptide libraries for characterisation of axin interactions with transiently binding proteins  |y eng 
245 1 0 |a Axinový interaktom: charakterizace transientních interakcí axinu za pomocí peptidových knihoven /  |c Eva Divišová 
264 0 |c 2017 
300 |a 121 stran :  |b ilustrace 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Lukáš Trantírek 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2017 
520 2 |a Axin je scaffold protein, hrající důležitou roli v několika buněčných signálních drahách. Schopnost Axinu interagovat s různými signálními proteiny nemusí být důležitá jenom pro přenos signálu v rámci jedné kaskády, ale také pro komunikaci a přepínání mezi jednotlivými drahami. Cílem mojí diplomové práce bylo analyzovat výsledky detailního mapování interakčního rozhraní mezi Axinem a Kasein kinázou 1ε, získané metodou Peptide microarray a ověřit tato data nezávislým alternativním přístupem. Analýzou peptidové knihovny Axinu byly identifikovány 3 kandidátní vazebné epitopy pro CK1ε: jeden v N-koncové doméně RGS a dva v nestrukturované centrální části Axinu. Výsledky byly validovány metodou in vitro pull down s delečními mutanty Axinu. Nepodařilo se však optimalizovat experimentální podmínky tak, aby nedocházelo k nespecifické vazbě rekombinantních proteinů na použitou matrici. Proto nebylo dosaženo jednoznačných závěrů.  |% cze 
520 2 9 |a Axin is a scaffold protein which plays a significant role in several signaling pathways. The ability of Axin to interact with various signaling proteins is important not only for signal transduction within a single pathway but also for the cross-talk and switching between individual pathways. The aim of my diploma thesis was to analyze results from detailed mapping of the interaction interface between Axin and Casein Kinase 1ε (CK1ε) obtained by the peptide microarray method and verify the data by an independent alternative approach. Analysis of an Axin peptide library led to identification of 3 candidate binding epitopes for CK1ε: one in the N-terminal RGS domain and two in the disordered central region of Axin. The results were validated with the in vitro pull-down method using deletion mutants of Axin. However, optimization of experimental conditions to prevent non-specific binding of the recombinant proteins to the used matrix was unsuccessful. Therefore, no definite conclusions co  |9 eng 
650 0 7 |a axin protein  |2 czmesh 
650 0 7 |a interakce protein-protein  |7 ph602153  |2 czenas 
650 0 7 |a kaseinkinasy  |2 czmesh 
650 0 9 |a Axin Protein  |2 eczenas 
650 0 9 |a Casein Kinases  |2 eczenas 
650 0 9 |a protein-protein interaction  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Genomika a proteomika  |c PřF N-BCH GEPR (GEPR)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Trantírek, Lukáš,  |d 1975-  |7 xx0129019  |% UČO 8725  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/379463/prif_m/ 
CAT |c 20170211  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20170217  |l MUB01  |h 1106 
CAT |c 20170313  |l MUB01  |h 1038 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0002 
CAT |c 20180202  |l MUB01  |h 1042 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1609 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1615 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1623 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1816 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0152 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0735 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |c 20200306  |l MUB01  |h 1848 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20201014  |l MUB01  |h 1051 
CAT |c 20210121  |l MUB01  |h 1011 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1022 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2009 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1251 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2349 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-03-13 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-13839  |5 3285012293  |8 20170217  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20170217  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-13839  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD