Zavedení kvantitativních proteomických metod pro studium Wnt signalizace /
Odpověď zprostředkovaná signální dráhou je komplexním procesem, jehož dynamická povaha a neustálá modulace odpovědi ztěžuje pochopení základních principů přenosu signálu. Metody založené na specifických protilátkách poskytují v mnoha případech uspokojující odpověď na řešenou otázku, ale pro získání...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Slovenština |
| Vydáno: |
2016
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/394106/prif_m/ |
| Shrnutí: | Odpověď zprostředkovaná signální dráhou je komplexním procesem, jehož dynamická povaha a neustálá modulace odpovědi ztěžuje pochopení základních principů přenosu signálu. Metody založené na specifických protilátkách poskytují v mnoha případech uspokojující odpověď na řešenou otázku, ale pro získání celkového obrazu o fungování dráhy a identifikaci všech interagujících součástí je tento přístup nedostačující. V posledních letech se do popředí dostávají přístupy hmotnostní spektrometrie umožňující sledování absolutních a relativních množství vybraných proteinů, jejich interakce a modifikace, a to na celoproteomové úrovni. Tato práce se zaměřila na signální dráhu Wnt, která u živočichů hraje zásadní roli v embryonálním vývoji a udržení homeostázy a její poruchy v mnoha případech vedou k rozvoji onkologických onemocnění. Metodami hmotnostní spektrometrie SRM a SWATH bylo zkoumáno množství izoforem proteinu Dishevelled v buněčných lyzátech a s použitím TMT značení sledované celoproteómové z Response mediated by a signaling pathway is a complex process, of which dynamic nature and ceaseless modulation of the response makes understanding of the basic signal transmission principles challenging. Specific antibody based methods in many cases offer a satisfactory answer to a question asked, however, to obtain a bigger picture about pathway functioning and to identify all its interacting parts is this approach insufficient. Recently, mass spectrometry based methods are being increasingly used to analyze relative and absolute quantities of selected proteins, their interactions and modifications, all on a proteome-wide level. This work was centered on Wnt signaling pathway, which plays an important role in embryonal development and homeostasis maintenance in animals and its defects are known to be involved in development of oncologic diseases. Mass spectrometry methods SRM and SWATH were used to inspect the amount of Dishevelled protein isoforms in cell lysates and using TMT label |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Vítězslav Bryja |
| Fyzický popis: | 86 listů, 9 nečíslovaných listů příloh |