Metody přístupu hledání targetové RNA proteinu ZCCHC9 /

Lidský protein ZCCHC9 je považován za jeden z faktorů zapojených do zpracování molekul RNA v buňce. Protein obsahuje motivy zinkových kloubů, které u podobných proteinu poskytují schopnost interagovat s nukleovými kyselinami a proteiny. Nicméně, způsob zapojení proteinu ZCCHC9 do těchto drah není zn...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Píš, Tomáš (Autor práce)
Další autoři: Vaňáčová, Štěpánka, 1972- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Slovenština
Vydáno: 2017
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/393296/prif_m/
Obálka
LEADER 05812ctm a22009137i 4500
001 MUB01006384769
003 CZ BrMU
005 20251128101525.0
008 170208s2017 xr ||||| |||||||||||slo d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-04-10 
035 |a (ISMU-VSKP)270539 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.113.8  |2 MRF 
080 |a 577.112  |2 MRF 
100 1 |a Píš, Tomáš  |7 xx0338785  |% UČO 393296  |4 dis 
242 1 0 |a Methodical approaches to search for the RNA targets of human ZCCHC9 protein  |y eng 
245 1 0 |a Metody přístupu hledání targetové RNA proteinu ZCCHC9 /  |c Tomáš Píš 
264 0 |c 2017 
300 |a 92 listů :  |b ilustrace 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2017 
520 2 |a Lidský protein ZCCHC9 je považován za jeden z faktorů zapojených do zpracování molekul RNA v buňce. Protein obsahuje motivy zinkových kloubů, které u podobných proteinu poskytují schopnost interagovat s nukleovými kyselinami a proteiny. Nicméně, způsob zapojení proteinu ZCCHC9 do těchto drah není znám, a proto je nutná jeho další charakterizace. Hlavním úkolem této diplomové práce byla identifikace jak proteinových, tak i RNA vazebných partnerů proteinu ZCCHC9, přičemž se jednalo převážně o molekuly zapojené do biogenese ribosomálních RNA (rRNA). Tato práce zahrnuje různé metody zkoumání interakcí mezi proteiny a RNA, přičemž jako potencionální substrátová RNA byla pro protein ZCCHC9 vytipována část ITS1 sekvence z 21S rRNA na základě dat publikovaných jiným pracovištěm. Experimentálními postupy se nám však zatím nepodařilo prokázat tuto interakci in vitro. Nicméně v práci se podařilo prokázat, že protein ZCCHC9 interaguje se dvěma proteiny z rodiny DEAD box helikáz, proteiny DDX5 a DD  |% cze 
520 2 9 |a Human protein ZCCHC9 is considered to be one of the factors involved in processing of RNA molecules in the cell. Protein contains zinc knuckle motifs, which provide the ability for similar proteins to interact with nucleic acids and proteins. However, the mechanism of involvement of ZCCHC9 into this pathways is not clear, therefore another charaterization is neccesary. The main aim of this diploma thesis was to indentify protein binding and RNA-binding partners of ZCCHC9, which were mostly molecules involved in the ribosomal RNA (rRNA) biogenesis. This thesis shows different approaches of studying interactions between protein and RNA, and ITS1 sequence of 21S ribosomal RNA was predicted as potencional RNA-binding molecule of ZCCHC9 protein, based on data published by another laboratory. By different approaches we were unable to obtain evidence of interaction in vitro. Nevertheless, we showed in this thesis that protein ZCCHC9 interacts with two proteins from DEAD box helicase family, p  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a RNA (nukleové kyseliny)  |7 ph125167  |2 czenas 
650 0 7 |a ZCCHC9  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a ribonucleic acids  |2 eczenas 
650 0 9 |a ZCCHC9  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF N-BCH BIOCH (BIOCH)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vaňáčová, Štěpánka,  |d 1972-  |7 mub2010613414  |% UČO 105562  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav biochemie  |7 ko2015866760  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/393296/prif_m/ 
CAT |c 20170208  |l MUB01  |h 0420 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170222  |l MUB01  |h 1301 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170223  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170223  |l MUB01  |h 1444 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20170314  |l MUB01  |h 1433 
CAT |c 20170410  |l MUB01  |h 1025 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170829  |l MUB01  |h 0007 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1609 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1615 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181107  |l MUB01  |h 1623 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1816 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2021 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2034 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 2143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0152 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190126  |l MUB01  |h 0209 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0735 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0740 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0742 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190307  |l MUB01  |h 0749 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1139 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1143 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1156 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190521  |l MUB01  |h 1437 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20200924  |l MUB01  |h 1319 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1022 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2009 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1251 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230314  |l MUB01  |h 2357 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240604  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0000 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240605  |l MUB01  |h 0003 
CAT |a VACOVAX  |b 02  |c 20251128  |l MUB01  |h 1015 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2017-04-10 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-13868  |5 3285012593  |8 20170314  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20170314  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-13868  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD