Charakterizace proteinových acetylací /
Acetylace je významná posttranslační modifikace, která hraje roli nejen při regulaci genové exprese. Za aktuální acetylační stav proteinů jsou zodpovědné lyzin acetyltransferázy (KAT) a lyzin deacetylázy (KDAC). Nesprávná regulace acetylací souvisí s řadou onemocnění, například vyšší exprese KDAC sp...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2016
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/391401/prif_m/ |
| Shrnutí: | Acetylace je významná posttranslační modifikace, která hraje roli nejen při regulaci genové exprese. Za aktuální acetylační stav proteinů jsou zodpovědné lyzin acetyltransferázy (KAT) a lyzin deacetylázy (KDAC). Nesprávná regulace acetylací souvisí s řadou onemocnění, například vyšší exprese KDAC spojená s hypoacetylací proteinů je typická pro rakovinné buňky. Silným nástrojem studia acetyloproteomu je hmotnostní spektrometrie (MS), která umožňuje jak identifikaci, tak kvantifikaci acetylovaných peptidů. Pro MS analýzu nízkoabundantních acetylovaných proteinů, respektive peptidů, je důležitá metoda obohacení těchto analytů. Tato práce je zaměřená na vývoj a optimalizaci afinitního obohacení acetylovaných peptidů s využitím protilátky. V průběhu optimalizace imunoprecipitačního protokolu se podařilo nejen navýšit celkový počet identifikovaných acetylovaných peptidů, ale i upravit dílčí kroky metodiky tak, aby byl celkový postup afinitního obohacení acetylovaných peptidů vzorku kompatibi Acetylation is an important post-translational modification that plays role not just in the regulation of gene expression. Acetylation status of proteins is managed by lysine acetyltransferase (KAT) and lysine deacetylase (KDAC). The wrong regulation of acetylation corresponds to certain diseases, for example, the overexpression of KDAC leading to protein hypoacetylation represents a typical feature of carcinoma cells. The preferred method used for acetylproteome studies is mass spectrometry (MS) which enables identification as well as quantification of acetylated peptides. The enrichment of low abundant acetylated proteins or peptides is essential for their analysis by mass spectrometry. This thesis is focused on the development and optimisation of acetylated peptide immunoaffinity enrichment. The total number of identified acetylated peptides has been increased during optimization of immunoprecipitation protocols. In addition, certain steps in the protocol have been modified in order |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Zbyněk Zdráhal |
| Fyzický popis: | 66 listů, 2 přílohy : ilustrace |