Analýza proteinových interakcí SMC a Nse podjednotek /

Proteinový komplex Smc5/6 (Structural Maintenance of Chromosomes) je potřebný při udržování stability chromatinu. Je tvořen dimerem Smc5-Smc6 a podjednotkami Nse1-6. Má nejspíše kruhovou strukturu, která je uzavřena podjednotkou Nse4, zvanou kleisin. Pro funkci komplexu je esenciální topologická vaz...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Nociar, Matej (Autor práce)
Další autoři: Paleček, Jan, 1966- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Slovenština
Vydáno: 2016
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/423704/prif_b/
Obálka
LEADER 06327ctm a22010457i 4500
001 MUB01006369182
003 CZ BrMU
005 20160909095754.0
008 160618s2016 xr ||||| |||||||||||slo d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-10-09 
035 |a (ISMU-VSKP)283746 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112  |2 MRF 
100 1 |a Nociar, Matej  |% UČO 423704  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Analysis of SMC and Nse subunits interactions  |y eng 
245 1 0 |a Analýza proteinových interakcí SMC a Nse podjednotek /  |c Matej Nociar 
264 0 |c 2016 
300 |a 60 listů :  |b ilustrace 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Jan Paleček 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2016 
520 2 |a Proteinový komplex Smc5/6 (Structural Maintenance of Chromosomes) je potřebný při udržování stability chromatinu. Je tvořen dimerem Smc5-Smc6 a podjednotkami Nse1-6. Má nejspíše kruhovou strukturu, která je uzavřena podjednotkou Nse4, zvanou kleisin. Pro funkci komplexu je esenciální topologická vazba s chromatinovým vláknem, avšak mechanismus zavedení a uvolnění tohoto komplexu na vlákno zatím není znám. Interakční rozhraní mezi Smc6/Nse4 a Smc5/Nse4 mohou být důležitým prvkem při zavádění a uvolňování komplexu z DNA. Bylo prokázáno, že Nse3 má roli při uzavíraní komplexu spolu s kleisinem Nse4. Dosavadní poznatky jsme použili na podrobnější studium interakce mezi Smc6/Nse3 a Smc6/Nse4, kterou se zabýváme v první části práce. V části druhé jsme pomocí mutací testovali interakci mezi Smc5/Nse4. Podařilo se nám identifikovat aminokyseliny na Smc6, které jsou specifické pro vazby Smc6/Nse3, Smc6/Nse4 a aminokyseliny na Smc5, jejichž mutace na alanin zruší vazbu Smc5/Nse4.  |% cze 
520 2 9 |a Protein complex Smc5/6 (Structural Maintenance of Chromosomes) is essential for maintaining stability of chromatin. It is formed by dimer Smc5-Smc6 and subunits Nse1-6. Presumably, complex has a „ring-like“ structure which is closed by subunit Nse4, known as kleisin. Topological encircling of DNA is essential for correct function of the complex, however the mechanism of loading and unloading of the complex from DNA is still unknown. Interaction interfaces between Smc6/Nse3, and Smc6/Nse4 could play important role in loading and unloading of the complex to DNA. It has been shown that Nse3 plays a role in closing of complex along with Nse4 kleisin. We used current knowledge of this interface to study interace Smc6/Nse3 and Smc6/Nse4, which we are dealing with in the first part of this work. In the second part, we analyzed the interaction interface between Smc5 and Nse4. We managed to identify aminoacids present at Smc6, which are specifically responsible for interaction with Nse3 and wit  |9 eng 
650 0 7 |a bílkoviny  |7 ph119082  |2 czenas 
650 0 7 |a Nse1-Nse3-Nse4  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a SMC proteiny  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a SMC5-6 complex  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a proteins  |2 eczenas 
650 0 9 |a SMC proteins  |2 eCZ-BrMU 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biochemie  |c PřF B-BCH BCHM (BCHM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Paleček, Jan,  |d 1966-  |7 xx0089354  |% UČO 38623  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/423704/prif_b/ 
CAT |c 20160618  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160901  |l MUB01  |h 1208 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20160909  |l MUB01  |h 0957 
CAT |c 20161009  |l MUB01  |h 2232 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20161031  |l MUB01  |h 1655 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170823  |l MUB01  |h 1602 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1219 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1019 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2006 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1246 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2353 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231106  |l MUB01  |h 1752 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-10-09 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-13304  |5 3285011428  |8 20160909  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20160909  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-13304  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD