Free energy calculations as a tool of supramolecular and biomolecular chemistry /
Volná energie je termodynamická veličina, jež poskytuje jedinečný popis stavu chemického systému. Úzce souvisí s kinetikou a rovnováhou chemických procesů. Lze tedy říci, že je důležitá pro pochopení všech důležitých procesů odehrávajících se v živých organismech jako jsou chemické reakce, folding p...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2015
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/106291/prif_d/ |
| Shrnutí: | Volná energie je termodynamická veličina, jež poskytuje jedinečný popis stavu chemického systému. Úzce souvisí s kinetikou a rovnováhou chemických procesů. Lze tedy říci, že je důležitá pro pochopení všech důležitých procesů odehrávajících se v živých organismech jako jsou chemické reakce, folding proteinů, vazba protein - ligand a mnoho dalších. Disertační práce je zaměřena na využití metod výpočtů volných energií (především pak metod koncového stavu a metod potenciálu střední síly) při řešení rozdílných problémů z oblastí supramolekulární a biomolekulární chemie. Hlavními studovanými systémy v této práci byly cucurbit[n]urily a jejich komplexy, enzym MutH, fragmenty RNA a chitinová nanovlákna. The free energy is a thermodynamical quantity that uniquely characterizes the state of a chemical system. Its change is intimately connected with kinetics and equilibrium of chemical processes. It is thus the key for understanding all the important processes taking place in living systems as the chemical reactions, protein folding, protein-ligand binding, and many others. This dissertation thesis is focused on the usage of free energy calculation methods, mainly end point methods and potential of the mean force methods, in solving different tasks from the areas of biomolecular and supramolecular chemistry. The systems studied in this thesis were the cucurbit[n]urils and their complexes, MutH enzyme, RNA fragments and chitin nanofibrils. |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jaroslav Koča |
| Fyzický popis: | 174 stran |