Aplikace nábojových deskriptorů v chemoinformatice /

Parciální atomové náboje jsou reálná čísla popisující rozložení elektronů v rámci molekuly a mají široké uplatnění v různých oblastech teoretické a výpočetní chemie. V chemoinformatice se využívají například při popisu interakce ligandu a receptoru nebo při predikci fyzikálně-chemických vlastností....

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Hejret, Václav (Autor práce)
Další autoři: Geidl, Stanislav, 1988- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2015
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/408320/prif_b/
Obálka
LEADER 06646ctm a22010697i 4500
001 MUB01006343307
003 CZ BrMU
005 20150921105454.0
008 150627s2015 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-03-09 
035 |a (ISMU-VSKP)270305 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 54  |x Chemie. Mineralogické vědy  |2 Konspekt  |9 10 
080 |a 54:007  |2 MRF 
100 1 |a Hejret, Václav  |% UČO 408320  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 0 |a Charge descriptors application in chemoinformatics  |y eng 
245 1 0 |a Aplikace nábojových deskriptorů v chemoinformatice /  |c Václav Hejret 
264 0 |c 2015 
300 |a viii, 70 listů :  |b tabulky +  |a 1 CD-ROM 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Stanislav Geidl 
502 |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2015 
520 2 |a Parciální atomové náboje jsou reálná čísla popisující rozložení elektronů v rámci molekuly a mají široké uplatnění v různých oblastech teoretické a výpočetní chemie. V chemoinformatice se využívají například při popisu interakce ligandu a receptoru nebo při predikci fyzikálně-chemických vlastností. Zde se tyto náboje používají ve formě nábojových deskriptorů. Přestože existuje několik kvantově mechanických i empirických metodik pro výpočet nábojů, většina současných softwarových nástrojů pro výpočet deskriptorů využívá pouze jednoduché Gasteiger-Marsili náboje. Navíc uvedené softwarové nástroje nabízí pouze zlomek z dostupných nábojových deskriptorů. Z tohoto důvodu je bakalářská práce zaměřena na vývoj nástroje pro výpočet nábojových deskriptorů, založených na libovolných atomových nábojích. Tento nástroj umožňuje výpočet 68 různých nábojových deskriptorů, jejichž definice byly převzaty především z literatury. Software je napsán v jazyce Python a umožňuje zpracovat tisíce běžných orga  |% cze 
520 2 9 |a Partial atomic charges are real numbers describing distribution of electron density in a molecule. They have a lot of applications in theoretical and computational chemistry. In chemoinformatics, they are used for description of ligand-receptor interaction or for prediction of physico-chemical properties. Specifically, the charges are in used in a form of charge descriptors. Several quantum mechanical and empirical approaches for charge calculation were developed. Regardless, most of software tools for calculation of charge descriptors use only simple Gasteiger-Marsili charges. Moreover, these software tools provide only a small part of currently available charge descriptors. For these reasons, the bachelor thesis is focused on development of charge descriptors based on arbitrary atomic charges. This tool allows calculation of 68 different charge descriptors and their definition was obtained from literature. The software is written in Python language and it is able to process thousands  |9 eng 
650 0 7 |a chemoinformatika  |7 ph270789  |2 czenas 
650 0 9 |a chemoinformatics  |2 eczenas 
655 7 |a bakalářské práce  |7 fd132403  |2 czenas 
655 9 |a bachelor's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Chemoinformatika a bioinformatika  |c PřF B-BCH CHI (CHI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Geidl, Stanislav,  |d 1988-  |7 mub2017960907  |% UČO 327887  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/408320/prif_b/ 
CAT |c 20150627  |l MUB01  |h 0422 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1453 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20150917  |l MUB01  |h 1410 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20150917  |l MUB01  |h 1411 
CAT |a FOLTYNOVA  |b 02  |c 20150921  |l MUB01  |h 1054 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1415 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0548 
CAT |c 20160303  |l MUB01  |h 1235 
CAT |c 20160308  |l MUB01  |h 1506 
CAT |c 20160309  |l MUB01  |h 1108 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170810  |l MUB01  |h 1052 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20170810  |l MUB01  |h 1107 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1420 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1015 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2002 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1238 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-03-09 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11036  |5 3285008280  |4 + 1 CD-ROM; Zůstává ve studovně  |7 Přílohu si vyžádejte u knihovníka u výpůjčního pultu  |8 20150921  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20150921  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11036  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD