Charakterizace kvasinkových jaderných RNA-vazebných proteinů v úpravách a degradaci RNA /
Nekódující RNA prochází řadou posttranskripčních úprav. Jedním z klíčových faktorů je proteinový komplex exosom. Exosom se skládá z devíti podjednotek, které tvoří katalyticky neaktivní strukturu podobnou barelu. S exosomem interagují dva proteiny - exoribonukleáza Rrp6p a endo- a exo- ribonukleáza...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2015
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/375611/prif_m/ |
| Shrnutí: | Nekódující RNA prochází řadou posttranskripčních úprav. Jedním z klíčových faktorů je proteinový komplex exosom. Exosom se skládá z devíti podjednotek, které tvoří katalyticky neaktivní strukturu podobnou barelu. S exosomem interagují dva proteiny - exoribonukleáza Rrp6p a endo- a exo- ribonukleáza Rrp44p. Tyto dva proteiny se vážou na exosom nezávisle na sobě. Hlavním aktivátorem exosomu v jádře je komplex TRAMP. Tento komplex se skládá z nekanonické poly(A) polymerázy Trf4p/Trf5p, RNA vazebného proteinu typu zinkových prstů Air1p/Air2p a RNA helikázy Mtr4p. Mtr4p hraje rozhodující roli jako aktivátor RNA exosomu. Nedávné studie odhalily, že Mtr4p ve své struktuře obsahuje doménu podobnou „ramenu“. Tato doména je potřebná pro degradaci a procesování RNA, ale ne pro helikázovou aktivitu Mtr4p. Stále není zcela jasné, jak je funkce této domény spojená s funkcemi Rrp6p nebo s exonukleázovou aktivitou Rrp44p. V této práci studujeme genetickou interakci mezi doménou podobnou „ramenu“ a exo Noncoding RNA undergoes a series of post-transcriptional modifications. One of the key factors in this process is protein complex called exosome. It contains nine subunits that form a catalytically inactive barrel-like structure. Two proteins exoribonuclease Rrp6p and endo- and exo- ribonuclease Rrp44p are able to interact with the exosome for its activation. These two proteins can bind the exosome independently of each other. TRAMP complex is the major exosome co-factor in the nucleus. This complex consists of the non-canonical poly(A) polymerases Trf4p/Trf5p, the zinc-knuckle RNA-binding proteins Air1p/Air2p and the RNA helicase Mtr4p. Mtr4p performs a crucial role in RNA processing and degradation as an activator of RNA exosome. Recent studies revealed that Mtr4p contains an arch-like domain. This domain is required for the RNA degradation and processing, but not for the helicase activity. It is not cleared, how the function of arch-domain is linked to the exosome function. In this |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Štěpánka Vaňáčová |
| Fyzický popis: | 57 listů |