Zavedení metody kvantifikace degradované DNA pomocí fluorescenčních PCR barviv /

Kvantifikace DNA je nezbytnou podmínkou dalších analýz u vzorků obsahujících degradovanou DNA nebo DNA o nízké koncentraci. Archaickou DNA je proto nutné kvantifikovat vždy. Pro kvantifikaci lidské jaderné aDNA je možné využít komerčně dostupné forenzní kity. Použití těchto kitů je však zpravidla ná...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Nováčková, Hana (Autor práce)
Další autoři: Boberová, Kateřina, 1982- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Čeština
Vydáno: 2015
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/375790/prif_m/
Obálka
LEADER 04887ctm a22007577i 4500
001 MUB01006342187
003 CZ BrMU
005 20170419123218.0
008 150620s2015 xr ||||| |||||||||||cze d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-08-11 
035 |a (ISMU-VSKP)252101 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035  |e rda 
072 7 |a 57/59  |x Biologické vědy  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 572  |2 MRF 
080 |a 572.71/.781:902  |2 MRF 
080 |a 577.21  |2 MRF 
080 |a 547.97-026.616  |2 MRF 
100 1 |a Nováčková, Hana  |% UČO 375790  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
242 1 4 |a The implementation of quantification methods of degraded DNA using PCR fluorescent dyes  |y eng 
245 1 0 |a Zavedení metody kvantifikace degradované DNA pomocí fluorescenčních PCR barviv /  |c Hana Nováčková 
264 0 |c 2015 
300 |a 73 listů, 5 nečíslovaných listů obrazových příloh :  |b fotografie kosterních nálezů 
336 |a text  |b txt  |2 rdacontent 
337 |a bez média  |b n  |2 rdamedia 
338 |a svazek  |b nc  |2 rdacarrier 
500 |a Vedoucí práce: Kateřina Boberová 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2015 
520 2 |a Kvantifikace DNA je nezbytnou podmínkou dalších analýz u vzorků obsahujících degradovanou DNA nebo DNA o nízké koncentraci. Archaickou DNA je proto nutné kvantifikovat vždy. Pro kvantifikaci lidské jaderné aDNA je možné využít komerčně dostupné forenzní kity. Použití těchto kitů je však zpravidla nákladné. Diplomová práce se proto zaměřuje na kvantifikaci aDNA pomocí real-time PCR s interkalačními barvivy, konkrétně s barvivy SYBR® Green a EvaGreen®. Cílem práce je ověřit použití vybraných master mixů s danými barvivy k amplifikaci a detekci produktů aDNA, a následně optimalizovat protokol pro kvantifikaci tak, aby mohl být dále použitelný v Laboratoři biologické a molekulární antropologie Ústavu experimentální biologie Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity.  |% cze 
520 2 9 |a DNA quantification is essential condition for further analyses of degraded or low copy number samples. Quantification of ancient DNA, therefore, is always necessary. For quantification of human nuclear aDNA it is possible to use commercial forensic kits. However the usage of these kits is usually expensive. Because of this the thesis focuses on quantification of aDNA by real-time PCR with intercalating dyes, specifically with SYBR® Green and EvaGreen®. The aim of this thesis is to verify the usage of chosen master mixes with these dyes for amplification and detection of products of aDNA. The final aim then is to optimize the reaction protocol for quantification so that it can be used in the Laboratory of Biological a Molecular Anthropology (Department of Experimental Biology, Faculty of Science, Masaryk University).  |9 eng 
650 0 7 |a fluorescenční barviva  |7 ph120267  |2 czenas 
650 0 7 |a fragmentace DNA  |2 czmesh 
650 0 7 |a kosterní pozůstatky člověka  |7 ph196690  |x analýza  |2 czenas 
650 0 7 |a kvantifikace DNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a kvantitativní polymerázová řetězová reakce  |2 czmesh 
650 0 7 |a molekulární antropologie  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a starobylá DNA  |2 CZ-BrMU 
650 0 9 |a ancient DNA  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a DNA quantitation  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a fluorescent dyes  |2 eczenas 
650 0 9 |a human remains (archaeology)  |x analysis  |2 eczenas 
650 0 9 |a molecular anthropology  |2 eCZ-BrMU 
650 0 2 |a DNA Fragmentation 
650 0 2 |a Real-Time Polymerase Chain Reaction 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Experimentální biologie  |b Molekulární biologie a genetika  |c PřF N-EXB BIMG (BIMG)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Boberová, Kateřina,  |d 1982-  |7 mzk2011654788  |% UČO 53399  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/375790/prif_m/ 
CAT |c 20150620  |l MUB01  |h 0421 
CAT |c 20150724  |l MUB01  |h 1145 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20150810  |l MUB01  |h 1446 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1453 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1414 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0547 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160503  |l MUB01  |h 1059 
CAT |c 20160811  |l MUB01  |h 1142 
CAT |c 20170119  |l MUB01  |h 1537 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20170419  |l MUB01  |h 1232 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1015 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 2002 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1238 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2016-08-11 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-12279  |6 3285009579  |5 3285009579  |8 20160503  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20160503  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-12279  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD