Mapování genotypů původce syfilis v celosvětovém měřítku
Bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum, způsobuje onemocnění syfilis. V práci jsou popsány dva hlavní způsoby molekulární typizace bakterie T. pallidum: CDC metoda a sekvenační metoda. Podle metody CDC byl jako dominantní typ bakterie určen ve většině zkoumaných oblastí typ 14d/f obsahující 14...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Čeština |
| Vydáno: |
2015
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/376261/prif_b_a2/ |
| LEADER | 04976ctm a22007457a 4500 | ||
|---|---|---|---|
| 001 | MUB01001024342 | ||
| 003 | CZ BrMU | ||
| 005 | 20150422140953.0 | ||
| 008 | 150217s2015 xr ||||| |||||||||||cze d | ||
| STA | |a POSLANO DO SKCR |b 2021-03-22 | ||
| 035 | |a (ISMU-VSKP)260375 | ||
| 040 | |a BOD114 |b cze |d BOD035 | ||
| 072 | 7 | |a 57/59 |x Biologické vědy |2 Konspekt |9 2 | |
| 080 | |a 616.972 |2 MRF | ||
| 080 | |a 579.81/.87+577.2 |2 MRF | ||
| 080 | |a 577.2 |2 MRF | ||
| 100 | 1 | |a Pajtina, Luboš |% UČO 376261 |* [absolvent LF MU] |4 dis | |
| 242 | 1 | 0 | |a Worldwide genotype mapping of the agent of syphilis |y eng |
| 245 | 1 | 0 | |a Mapování genotypů původce syfilis v celosvětovém měřítku |h [rukopis] / |c Luboš Pajtina |
| 260 | |c 2015 | ||
| 300 | |a 50 l. | ||
| 500 | |a Vedoucí práce: David Šmajs | ||
| 502 | |a Bakalářská práce (Bc.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2015 | ||
| 520 | 2 | |a Bakterie Treponema pallidum subsp. pallidum, způsobuje onemocnění syfilis. V práci jsou popsány dva hlavní způsoby molekulární typizace bakterie T. pallidum: CDC metoda a sekvenační metoda. Podle metody CDC byl jako dominantní typ bakterie určen ve většině zkoumaných oblastí typ 14d/f obsahující 14 kopií 60-pb dlouhé repetitivní sekvence v genu arp, restrikční profil d získaný z genů tprE, tprG, tprJ a sekvenční variantu f genu TP0548. Při použití sekvenačního typovacího systému (sekvenace genů TP0136, TP0548 a 23S rRNA) měly klinické izoláty T. pallidum subsp. pallidum nejčastěji genotyp SSS. Byla zaznamenána vysoká diverzita populace kmenů T. pallidum, která se mění v průběhu času. Po kombinaci obou metod typizace bakterie bylo pozorováno geografické rozložení jednotlivých genotypů. Většina klinických izolátů, izolovaných z různých částí světa, byla sekvenčně příbuzná referenčnímu kmeni SS14. |% cze | |
| 520 | 2 | 9 | |a Bacteria Treponema pallidum subspecies pallidum is the causative agent of syphilis. This work describes the two main approaches for molecular typing of T. pallidum: the CDC typing and the sequencing-based typing system. Using the CDC typing, genotype 14d/f was detected as the most abundant type containing 14 repeats of the 60-bp long sequence in the arp gene, restriction profile d acquired from tprE, tprG, tprJ genes and sequence type f of TP0548 gene. Sequencing-based typing, which is based on sequencing of TP0136, TP0548 and 23S rRNA genes, identified genotype SSS as the most abundant type among tested T. pallidum clinical isolates. Moreover, high diversity of T. pallidum strains within the same geographic location was detected during time. Combining the results from both methods of molecular typing, a geographical distribution of genotypes was observed. Most of the clinical strains isolated worldwide showed sequence relatedness to SS14 strain. |9 eng |
| 650 | 0 | 7 | |a genotypizační techniky |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulární bakteriologie |7 ph705657 |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulární biologie |7 ph115344 |x metody |2 czenas |
| 650 | 0 | 7 | |a molekulární typizace |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a syfilis |x mikrobiologie |2 czmesh |
| 650 | 0 | 7 | |a Treponema pallidum |2 czmesh |
| 650 | 0 | 9 | |a molecular bacteriology |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a molecular biology |x methods |2 eczenas |
| 650 | 0 | 9 | |a molecular biology |2 eczenas |
| 650 | 0 | 2 | |a Genotyping Techniques |
| 650 | 0 | 2 | |a Molecular Typing |
| 650 | 0 | 2 | |a Syphilis |
| 655 | 7 | |a bakalářské práce |7 fd132403 |2 czenas | |
| 655 | 9 | |a bachelor's theses |2 eczenas | |
| 658 | |a Experimentální biologie |b Molekulární biologie a genetika |c PřF B-EXB BIMG (BIMG) [pokus č.2] |2 CZ-BrMU | ||
| 700 | 1 | |a Šmajs, David, |d 1969- |7 xx0061318 |% UČO 1116 |4 ths | |
| 710 | 2 | |a Masarykova univerzita. |b Ústav experimentální biologie |7 mzk2008412438 |4 dgg | |
| 856 | 4 | 1 | |u http://is.muni.cz/th/376261/prif_b_a2/ |
| CAT | |c 20150217 |l MUB01 |h 0420 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20150224 |l MUB01 |h 1057 | ||
| CAT | |a MENSIKOVA |b 02 |c 20150422 |l MUB01 |h 1409 | ||
| CAT | |c 20150703 |l MUB01 |h 1253 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20150804 |l MUB01 |h 1804 | ||
| CAT | |c 20150901 |l MUB01 |h 1453 | ||
| CAT | |c 20150921 |l MUB01 |h 1414 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20151226 |l MUB01 |h 0534 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160510 |l MUB01 |h 1235 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20160731 |l MUB01 |h 2236 | ||
| CAT | |a HANAV |b 02 |c 20170829 |l MUB01 |h 0007 | ||
| CAT | |a FUKSOVAX |b 02 |c 20200913 |l MUB01 |h 1821 | ||
| CAT | |c 20210322 |l MUB01 |h 0938 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 1013 | ||
| CAT | |c 20210614 |l MUB01 |h 2000 | ||
| CAT | |a BATCH |b 00 |c 20210724 |l MUB01 |h 1235 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231012 |l MUB01 |h 2055 | ||
| CAT | |a POSPEL |b 02 |c 20231204 |l MUB01 |h 1957 | ||
| LOW | |a POSLANO DO SKCR |b 2021-03-22 | ||
| 994 | - | 1 | |l MUB01 |l MUB01 |m VYSPR |1 KUK |a Knihovna univ. kampusu |2 SKLAD |b KUK - sklad |3 PřF-K-9864 |6 3285007642 |5 3285007642 |8 20150422 |f 71 |f Prezenční SKLAD |r 20150422 |s převod |
| AVA | |a MED50 |b KUK |c KUK - sklad |d PřF-K-9864 |e available |t K dispozici |f 1 |g 0 |h N |i 0 |j SKLAD | ||