Engineering of the synthetic metabolic pathway for biodegradation of an environmental pollutant

Tato práce popisuje využití metod syntetické biologie a metabolického inženýrství k racionálnímu redesignu metabolické dráhy pro biodegradaci důležitého environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu (TCP). V úvodu práce jsou čtenáři přiblíženy nové technologie a přístupy pro inženýrství biosynte...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Dvořák, Pavel, 1983- (Autor práce)
Další autoři: Damborský, Jiří, 1969- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/151419/prif_d/
Obálka
LEADER 05403ctm a22008057a 4500
001 MUB01001016531
003 CZ BrMU
005 20231129122911.0
008 141113s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-03-08 
035 |a (ISMU-VSKP)179746 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
041 0 |a eng  |b cze 
072 7 |a 60  |x Biotechnologie. Genetické inženýrství  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 602.66  |2 MRF 
080 |a 602:577.112  |2 MRF 
080 |a 502.174:628.4.042  |2 MRF 
080 |a 547.412.6  |2 MRF 
080 |a 57/59:004  |2 MRF 
100 1 |a Dvořák, Pavel,  |d 1983-  |7 mub20211115889  |% UČO 151419  |4 dis 
242 1 0 |a Engineering of the synthetic metabolic pathway for biodegradation of an environmental pollutant  |y eng 
245 1 0 |a Engineering of the synthetic metabolic pathway for biodegradation of an environmental pollutant  |h [rukopis] /  |c Pavel Dvořák 
260 |c 2014 
300 |a 165 l. 
500 |a Vedoucí práce: Jiří Damborský 
502 |a Dizertace (Ph.D.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Tato práce popisuje využití metod syntetické biologie a metabolického inženýrství k racionálnímu redesignu metabolické dráhy pro biodegradaci důležitého environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu (TCP). V úvodu práce jsou čtenáři přiblíženy nové technologie a přístupy pro inženýrství biosyntetických a biodegradačních drah společně s původem a počátky studia syntetické TCP dráhy. Dráha, která se skládá ze tří enzymů - halogenalkandehalogenasy, haloalkoholdehalogenasy a epoxidhydrolasy - pocházejících ze dvou různých mikroorganismů, dokáže přeměnit toxický TCP na neškodný produkt glycerol. Efektivita této přeměny je však negativně ovlivněna několika významnými limitacemi dráhy. Čtyři studie, které jsou shrnuty ve výsledkové části této práce, se snaží tato omezení popsat, racionálně optimalizovat fungování dráhy a připravit biokatalyzátor, který by mohl být využit k dekontaminaci míst znečištěných TCP. Kapitola 1 výsledkové části popisuje rekonstrukci modelové dráhy v podmínkách in  |% cze 
520 2 9 |a This Thesis describes the application of synthetic biology and metabolic engineering approaches for rational redesign of metabolic pathway for biodegradation of important environmental pollutant 1,2,3-trichloropropane (TCP). The emerging technologies for engineering of biosynthetic and biodegradation pathways are described in the Introduction of the Thesis and prologue to the origins of synthetic TCP route is provided. The pathway consisting of three enzymes - haloalkane dehalogenase, haloalcohol dehalogenase and epoxide hydrolase - from two different microorganisms can convert toxic TCP into harmless product glycerol but suffers from several important bottlenecks. The four studies described in the Results section of the Thesis aim at rational dissection of these handicaps, optimization of pathway performance and construction of biocatalyst utilizable for TCP removal from the contaminated sites. Chapter 1 of the Results section describes reconstruction of the model pathway in in vitro  |9 eng 
650 0 7 |a biodegradace  |7 ph137835  |2 czenas 
650 0 7 |a biokatalýza  |2 czmesh 
650 0 7 |a biologické modely  |2 czmesh 
650 0 7 |a metabolické inženýrství  |x metody  |2 czmesh 
650 0 7 |a syntetická biologie  |7 ph613275  |x metody  |2 czenas 
650 0 7 |a trichlorpropan  |7 ph241636  |2 czenas 
650 0 9 |a biodegradation  |2 eczenas 
650 0 9 |a synthetic biology  |x methods  |2 eczenas 
650 0 9 |a trichloropropane  |2 eczenas 
650 0 2 |a Biocatalysis 
650 0 2 |a Metabolic Engineering 
650 0 2 |a Models, Biological 
655 7 |a disertace  |7 fd132024  |2 czenas 
655 9 |a dissertations  |2 eczenas 
658 |a Biologie (čtyřleté)  |b Molekulární a buněčná biologie  |c PřF D-BI4 MBBI (MBBI)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Damborský, Jiří,  |d 1969-  |7 mzk2006348900  |% UČO 1441  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Ústav experimentální biologie  |7 mzk2008412438  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/151419/prif_d/ 
CAT |c 20141113  |l MUB01  |h 0422 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141113  |l MUB01  |h 0650 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141113  |l MUB01  |h 0703 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20141119  |l MUB01  |h 1444 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1414 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0525 
CAT |a MENSIKOVA  |b 02  |c 20160120  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20160829  |l MUB01  |h 1628 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170502  |l MUB01  |h 1655 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170731  |l MUB01  |h 1711 
CAT |a VASICEKX  |b 02  |c 20201104  |l MUB01  |h 1140 
CAT |c 20210308  |l MUB01  |h 1029 
CAT |a FUKSOVAX  |b 02  |c 20210601  |l MUB01  |h 1110 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1012 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1233 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230920  |l MUB01  |h 0942 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20231129  |l MUB01  |h 1229 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240703  |l MUB01  |h 0129 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-03-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-11126  |6 3285008532  |5 3285008532  |8 20160120  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20160120  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-11126  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 1  |j SKLAD