Engineering of the synthetic metabolic pathway for biodegradation of an environmental pollutant
Tato práce popisuje využití metod syntetické biologie a metabolického inženýrství k racionálnímu redesignu metabolické dráhy pro biodegradaci důležitého environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu (TCP). V úvodu práce jsou čtenáři přiblíženy nové technologie a přístupy pro inženýrství biosynte...
Uloženo v:
| Hlavní autor: | |
|---|---|
| Další autoři: | |
| Typ dokumentu: | VŠ práce nebo rukopis |
| Jazyk: | Angličtina |
| Vydáno: |
2014
|
| Témata: | |
| On-line přístup: | http://is.muni.cz/th/151419/prif_d/ |
| Shrnutí: | Tato práce popisuje využití metod syntetické biologie a metabolického inženýrství k racionálnímu redesignu metabolické dráhy pro biodegradaci důležitého environmentálního polutantu 1,2,3-trichlorpropanu (TCP). V úvodu práce jsou čtenáři přiblíženy nové technologie a přístupy pro inženýrství biosyntetických a biodegradačních drah společně s původem a počátky studia syntetické TCP dráhy. Dráha, která se skládá ze tří enzymů - halogenalkandehalogenasy, haloalkoholdehalogenasy a epoxidhydrolasy - pocházejících ze dvou různých mikroorganismů, dokáže přeměnit toxický TCP na neškodný produkt glycerol. Efektivita této přeměny je však negativně ovlivněna několika významnými limitacemi dráhy. Čtyři studie, které jsou shrnuty ve výsledkové části této práce, se snaží tato omezení popsat, racionálně optimalizovat fungování dráhy a připravit biokatalyzátor, který by mohl být využit k dekontaminaci míst znečištěných TCP. Kapitola 1 výsledkové části popisuje rekonstrukci modelové dráhy v podmínkách in This Thesis describes the application of synthetic biology and metabolic engineering approaches for rational redesign of metabolic pathway for biodegradation of important environmental pollutant 1,2,3-trichloropropane (TCP). The emerging technologies for engineering of biosynthetic and biodegradation pathways are described in the Introduction of the Thesis and prologue to the origins of synthetic TCP route is provided. The pathway consisting of three enzymes - haloalkane dehalogenase, haloalcohol dehalogenase and epoxide hydrolase - from two different microorganisms can convert toxic TCP into harmless product glycerol but suffers from several important bottlenecks. The four studies described in the Results section of the Thesis aim at rational dissection of these handicaps, optimization of pathway performance and construction of biocatalyst utilizable for TCP removal from the contaminated sites. Chapter 1 of the Results section describes reconstruction of the model pathway in in vitro |
|---|---|
| Popis jednotky: | Vedoucí práce: Jiří Damborský |
| Fyzický popis: | 165 l. |