Simulations of self-assembly of amphiphilic peptides

Amfifilní peptidy jsou schopné se samovolně uspořádávat do různých struktur v závislosti na svých vlastnostech. Některé takto uspořádané struktury mohou být pro různé organismy nebezpečné, jiné zase naopak nutné pro přežití. Studium vlastností a chování takových struktur je tedy velice důležité a mů...

Celý popis

Uloženo v:
Podrobná bibliografie
Hlavní autor: Hřeben, Pavel (Autor práce)
Další autoři: Vácha, Robert, 1980- (Vedoucí práce)
Typ dokumentu: VŠ práce nebo rukopis
Jazyk:Angličtina
Vydáno: 2014
Témata:
On-line přístup:http://is.muni.cz/th/323497/prif_m/
Obálka
LEADER 06137ctm a22010817a 4500
001 MUB01001000937
003 CZ BrMU
005 20150401102218.0
008 140625s2014 xr ||||| |||||||||||eng d
STA |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
035 |a (ISMU-VSKP)253993 
040 |a BOD114  |b cze  |d BOD035 
072 7 |a 577  |x Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika  |2 Konspekt  |9 2 
080 |a 577.112.5/.6  |2 MRF 
080 |a 519.245  |2 MRF 
100 1 |a Hřeben, Pavel  |% UČO 323497  |* [absolvent PřírF MU]  |4 dis 
245 1 0 |a Simulations of self-assembly of amphiphilic peptides  |h [rukopis] /  |c Pavel Hřeben 
246 1 1 |a Simulace samovolného uspořádaní amfifilních peptidů 
260 |c 2014 
300 |a 51 l. 
500 |a Vedoucí práce: Robert Vácha 
502 |a Diplomová práce (Mgr.)--Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, 2014 
520 2 |a Amfifilní peptidy jsou schopné se samovolně uspořádávat do různých struktur v závislosti na svých vlastnostech. Některé takto uspořádané struktury mohou být pro různé organismy nebezpečné, jiné zase naopak nutné pro přežití. Studium vlastností a chování takových struktur je tedy velice důležité a může být využito pro ovlivňování jejich tvorby v buňce, či k vytváření umělých biomateriálů. V této práci byly studovány vlastnosti a chování α-helikálních amfifilních peptidů známých jako coiled coils. Ke studiu byly použity počítačové simulace s metodou Monte Carlo a také nový zhrubený model peptidů. V simulacích jsme byli schopni získat různé struktury. Také jsme byli schopni ovlivnit velikost výtěžku. Podmínky uspořádávání těchto struktur závisely na parametrech simulací i na parametrech modelu.  |% cze 
520 2 9 |a Amphiphilic peptides are capable to perform self-assembly into large variety of structures. These structures depends on characteristics of these peptides. Some of these structures can be dangerous for some organisms, but they can be also vital for cells. It is very important to study their behaviour and characteristics because such information could be used to induce their production in cells, or to make new biomaterials. In this study, we focused on α-helical amphiphilic peptides known as coiled coils. We used Monte Carlo simulations and new coarse grained model of the peptides. We were able to obtain specific structures in simulations. We were able to affect quantity of the yield. The yield of such structures depended on parameters of simulations and parameters of the model.  |9 eng 
650 0 7 |a amfifilní peptidy  |2 CZ-BrMU 
650 0 7 |a metoda Monte Carlo  |7 ph122780  |2 czenas 
650 0 9 |a amphiphilic peptides  |2 eCZ-BrMU 
650 0 9 |a Monte Carlo method  |2 eczenas 
655 7 |a diplomové práce  |7 fd132022  |2 czenas 
655 9 |a master's theses  |2 eczenas 
658 |a Biochemie  |b Biomolekulární chemie  |c PřF N-BCH BIOM (BIOM)  |2 CZ-BrMU 
700 1 |a Vácha, Robert,  |d 1980-  |7 mub2013763354  |4 ths 
710 2 |a Masarykova univerzita.  |b Národní centrum pro výzkum biomolekul  |7 kn20100614011  |4 dgg 
856 4 1 |u http://is.muni.cz/th/323497/prif_m/ 
CAT |c 20140625  |l MUB01  |h 0421 
CAT |a VASICEK  |b 02  |c 20140711  |l MUB01  |h 0924 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20141104  |l MUB01  |h 1320 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20150107  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a REPISOVA  |b 02  |c 20150401  |l MUB01  |h 1022 
CAT |c 20150901  |l MUB01  |h 1452 
CAT |c 20150921  |l MUB01  |h 1413 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20151203  |l MUB01  |h 1045 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20151226  |l MUB01  |h 0503 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20170223  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a HANAV  |b 02  |c 20180802  |l MUB01  |h 1634 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20180828  |l MUB01  |h 0911 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20181106  |l MUB01  |h 0732 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190105  |l MUB01  |h 1433 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190228  |l MUB01  |h 1419 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190605  |l MUB01  |h 1343 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20190620  |l MUB01  |h 0746 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 0850 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1211 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20191210  |l MUB01  |h 1218 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1134 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200123  |l MUB01  |h 1137 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20200323  |l MUB01  |h 1959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1126 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201030  |l MUB01  |h 1127 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20201112  |l MUB01  |h 0515 
CAT |a PTICHAX  |b 02  |c 20210203  |l MUB01  |h 1834 
CAT |c 20210208  |l MUB01  |h 1138 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210217  |l MUB01  |h 2157 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210525  |l MUB01  |h 1148 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1010 
CAT |c 20210614  |l MUB01  |h 1957 
CAT |a BATCH  |b 00  |c 20210724  |l MUB01  |h 1230 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20210819  |l MUB01  |h 1812 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220324  |l MUB01  |h 2121 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220811  |l MUB01  |h 2150 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20220929  |l MUB01  |h 2118 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221004  |l MUB01  |h 0159 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20221220  |l MUB01  |h 0136 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230228  |l MUB01  |h 0105 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2352 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2354 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230331  |l MUB01  |h 2355 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230730  |l MUB01  |h 2154 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20230910  |l MUB01  |h 2311 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231013  |l MUB01  |h 0910 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231110  |l MUB01  |h 0959 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20231212  |l MUB01  |h 0014 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240313  |l MUB01  |h 0026 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240415  |l MUB01  |h 0036 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240519  |l MUB01  |h 0019 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240613  |l MUB01  |h 2039 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240701  |l MUB01  |h 2141 
CAT |a POSPEL  |b 02  |c 20240729  |l MUB01  |h 2338 
LOW |a POSLANO DO SKCR  |b 2021-02-08 
994 - 1 |l MUB01  |l MUB01  |m VYSPR  |1 KUK  |a Knihovna univ. kampusu  |2 SKLAD  |b KUK - sklad  |3 PřF-K-10126  |5 3285006741  |8 20140711  |f 71  |f Prezenční SKLAD  |r 20140711  |s převod 
AVA |a MED50  |b KUK  |c KUK - sklad  |d PřF-K-10126  |e available  |t K dispozici  |f 1  |g 0  |h N  |i 0  |j SKLAD